EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10167 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:2480137-2481587 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr25:2481328-2481342TTTTTAAATATTAG-6.13
Foxd3MA0041.1chr25:2481319-2481331AAATGTTTGTTT+6.27
ZSCAN4MA1155.1chr25:2480959-2480974CACACACACTGAAAT+6.65
Enhancer Sequence
CTATTAGACT TCTTTTAAAT ACAAAAATCA TTCATTTTCA AAGGTTTGCA ATTTCAGACC 60
GCTAAACCAA AACTGCCTAA AACAAAACTG CCAAACGCTT AATAAAATCT AGTTTTTCAT 120
TGAAAATGTA GAGTAAACAC CAACCTTCCA ACACATATCA ACATCCACAA CGCCATAACT 180
ACACCCTAGC AACTATACAC CAAAATGCTT GAAATATTTC AAACTTCTCT GCCTTTTCTA 240
CAAGTTTAAG CACAACTAAA TGTCTGCTTG AGTTGCAGTC AGCAAAGCAG ATGGAAAAGC 300
GTCCTCCTTT TGGCTCCATT CTTTCTTCCT CTCTTCAACT CATCCTTTGA CCTCGTGACT 360
ATTTATGAGA GTCATTTAGA GGGAGTCATT AGTCACAGAG CAGAGCCAAA CAACTCGTCC 420
TATCAGCCTG CATTTAAAAG ATCCTACCCA GAAAATCTGC ACGCACACAC ATGCACACTC 480
ACACGCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAAACAC 540
GGATGTACAC ACAGAGGAAT CAAACACACA CATTCACACA CACACACAGA AACCAAACAC 600
GCACACTGAA ATCAAACAAA CACAGGCACA AAAAAATGCA CACACCACAC AGACACACTC 660
TCAGACAAAG AAATCAAACA CACTCACACA CACAAAGTAA TCAAACACAC ACACACACAG 720
AGAAATAAAA AAACACACAC AGAAATCAAA CACACTCACA CACACAAAGT AATCAAACAC 780
ACACACACAC AGAGAAATAA AAAAACACAC ACAGAAATCA AACACACACA CTGAAATCAA 840
ACAAACACAG GCACAAAAAA TGCACACACC ACACAGACAC ACTCACAGAC AAAAAAATCA 900
AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACAGA 960
GTAATCAAAC ACACACAGAG ACATAAAAAG CACACACAGA AATCAAACAC ACACAAGCAC 1020
AAACACACTC ACACACAGAT AGAAATCACA AAGTATCAGA CACAGTATAA AAGTATAAGA 1080
GTAATCAGAC ACACACATTC ACACACGCAC ACACACACAC ACACACATTG AACTCTGGGA 1140
ATAACTCAAA ACAGCCATAT TATTCCATCA CCCTAACTTG CAAAATGTTT GTTTTTAAAT 1200
ATTAGAGAGA CAAAAACAAA CAGGTGAACA AGACAATAGG GAGACTAATA AATAAAAATG 1260
AATAAATATA TAAAAATAAA TAAAATAAAT AAAATTAAAT GAATAAGTAA AAATAAATAA 1320
ATAAAAATAC ATTAAATAAA TAAAATTAAA TGAATAAAAA AACAAATAAA AAATAAAAAA 1380
ATAATTAAAT ACAAATGAGT TATTAAAAAT AAAATAAATA AATAAAAAGA AATGAAATAA 1440
ATAAAAAGAA 1450