EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10156 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:1605779-1608284 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr25:1606413-1606425CAGCATATGTTT-6.04
RFX1MA0509.2chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT+6.38
RFX1MA0509.2chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT-6.38
RFX1MA0509.2chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT-7.32
RFX1MA0509.2chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT+7.33
RFX2MA0600.2chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT+6.28
RFX2MA0600.2chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT-6.38
RFX2MA0600.2chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT-7.43
RFX2MA0600.2chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT+7.48
RFX3MA0798.1chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT-6.28
RFX3MA0798.1chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT+7.15
RFX3MA0798.1chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT-7.43
RFX4MA0799.1chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT-7.25
RFX4MA0799.1chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT+7.33
RFX5MA0510.2chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT+6.02
RFX5MA0510.2chr25:1606369-1606385TGTTGTTATGGCAACT-6.17
RFX5MA0510.2chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT-7.51
RFX5MA0510.2chr25:1608106-1608122TGTTGCCATGGTAACT+7.58
Enhancer Sequence
TCACCACAGA TCACGCGAAA CATCTCACAA TGGGCTCTAC TGTGTGTGTG GTGATTAGCG 60
TGTTAGCATG TCGTCAGTGA GAGAAAGACG ATCCGCCGTC ATTAGCAGAT ACCCAGCGCT 120
TCAGATTGTG TGCTGTTCCT CCAACAGGGG CCTGACCTAT GAAGCCGGAT TAGCTGGTTA 180
GCTAGTTACA TTTCAATTTA GTTTGCACAA ACTTGGGTCT TGGTACCACG AAGGTAGCTT 240
GGGTTTAATC ACTGTTTATT GTCATGGTAA CTTATGCTGC ATGGCTAACC TTGTCCTGCA 300
CAGGACATGT TCAGGTGATC TTCTGTTTAT GTTTTGGTCA TGTTCAGGTA ATGCTCAGGT 360
TATCTTCTAG TTATGTTCTT TTTTATGTTA TTTTCTGGTT ATAAGTTCTG GTTATGTTAA 420
GATTTTTGTA TGCTAGCAGA TATACTCAGT GCTTCAGATT TTGTGCTGTT CCTCAATCAG 480
GGGCCTGTAC TATGAAGCCG GATTAGCTGG TTAGCCAGTT AAATTTCAGT TTAGTTTGCA 540
CAAATCTGGG CTTTTGGTAC CATGAAGGTA GCTTGGGTTT AATCACTGTT TGTTGTTATG 600
GCAACTTTTG CTGCATGGCT AACTTTTTCT TGCACAGCAT ATGTTTTGGT TATGTTCAGG 660
TTATCTTCTG GTTATGTTCT TTTTTATGTT ATTTTCTGGT TATGTTCAGG TTATCTTCTG 720
GTTATGTTCT TTTTTATGTT ATTTTCTGGT TATATGTTCT GGTTATGTTC AGGTTATCTC 780
CTGGTTATGT TCTTTTTTTT AGGTTATTTT CTGGGTATAT ATTCTAGGTA TGTTCAGGTG 840
ATTTTCTGGT TATGCTCTTT TTAGGTTGTT TTCTGATTAT ATGTTCTGGT TATGTTCAGG 900
TTATCTTCTG GTTATGTTCT TTTTTAGGTT ATTTTCTGGT TATGTGTTCT AGTTATGTTC 960
AGGTTATCTT CTGGTTATGT TCTTTTTTAG GTTATTTTCT GGTTATGTGT TCTAGTTATG 1020
TTTAGGTTAT CTTCTGGTTA AGTTCTTTTT AGGTTATTTT CTGGTTATGT GTTCTAATTA 1080
TGTTCAGGTT ATCTTCCGGT TATGTTCTTT TTTTGTAGGT TATTTTCTGG TTATATATTC 1140
TAGTTATGTT CAGGTGATTT TCTGGTTATG CTCTTTTTAG GTTGTTTTCT GATTATATGT 1200
TCTGGATATG TTCAGGTTAT CTTCAGGTTA TGTTCTTTTT TAGGTTATAT TCTGGTTGTT 1260
CTTTTTTTAG ATTATATCTG GATATATGTT CTGGTTATGT TCAGGTTATC TTTTGGTTAT 1320
GTTCTTTTTA GGTTATATTC TGGTTATGTT CTTTTTTTTA GATTATATCT GGATAAATGT 1380
TCTGGGTATG TTCAGGTTAT CTTTTGGTTA TTTTCTTTTT TAGGTTATAT TCTGGTTATA 1440
TGTTCTGGTT ATGTGTTTAT GTTATCTTCT GGTTATATGT TCTGGTTATG TTATGTTCAG 1500
GTTATCTTCT GGTAATGCTC TATTTTAAGT TATTTTCTGG CTATATGTTC TGGTTACGTT 1560
CAGATTTTAT TCTATGTTCT GTTTATGTTC AGGTTTTGTT TTTTTAATTC TCTGGTTATT 1620
TTCTGGTTAT GTTCAGGTTA TTTTTTAAGG TTATGTTCTG GCTATGCTTT CATTATATAG 1680
GTTTTATGTT TTGGCTATGT TCAGGTTATG TTCCATTTAT GGGTTTATGT TGGTTATGAT 1740
AATTTTTAGA TTTTTTTGGT TATGTTCTGT TTATGTTTAC GTTTTAATAA TGTTCAGGTT 1800
ATGTTGTTTA TGGGTTCAGG TTAGGTTATG GTTATGTGCT CAGGTTAAGT AGGTTATTTT 1860
CTGGTTATAT GTTCTGGTTA TCTTCTAGTA ATGTTCTTTT TTAGATTTTT TCTGGTTATA 1920
TGTTTTGACT ATGTTTAGGT TTTGTTCTAT GTTCTGGTTA TGTTCAGATT TTATTTTCTT 1980
TATGCTCTGG TCATGCTTAC ATTATATTAC AACTTATGCT GCATGGCTAA CTTGTTCTGG 2040
GGCCGGATAT GGTCAGATTA TCTTCTGGTC ATTCTGTTTT TTTTAAGGTT ATTTTCTGGT 2100
TATATTCTGT TTATGTTCAG GTTTTATTTT CTTTATGCTC TGGTTATGCT CACATTATAT 2160
TCTGTTTATG CTTTGGTTAT GTTCAGGTTA TGTTCTATTT ATGAGTTCAG CTTATGTTCA 2220
GGTTATCTAT TGGTTATGTT CTGTTTATAT ACTCAGGTTA AGGTTCAGTT TAATTTGCAC 2280
CAATCCTGGG TTTTTGATAC CACAAAAGTA GCTTGGCTTT AATCACTTGT TGCCATGGTA 2340
ACTTATGCTG CATGGCTAAC TTGTTCTGGG GCATGATAAG TTCAGTTTAT CTTCTGGTTA 2400
TTCTAGATAT TCTGTGTTGG TTTTGTGTTC AGGTTAGGTT TACATTATGT TCAGCTTATA 2460
TGTTCAGGTT CTGTTGGCTA TGGATGTCCT GCCTTCATTT GCACA 2505