EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10123 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:139629-141279 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr25:140999-141016AGAAAATAAACAAATAA+6.3
RREB1MA0073.1chr25:140870-140890TGTGTGTGTGTGTGTTGGTG-6.14
ZSCAN4MA1155.1chr25:139698-139713CGCACACACTTAAAC+6.47
Enhancer Sequence
GCACATCAAC ACATACTTCA GGACAATATC AGCATTATCC ATGCACACAC ACACACACAC 60
ACACACACAC GCACACACTT AAACACACAC ACACGCACGC GCACACACGC GCACACGCGC 120
AAACACGCAC ACACTTACAC ACACACACAC ACACACTGAG TCACACATGT AGAAGTGCAC 180
TCGCGTGTTT CTAGTCCAGA AATGTCAACA TTCTTAAATC CGTCAGCTCT GTGTAGAGCA 240
GCAGAGACAC TGCGGGAGCA GTTACAGCAC ACTCGCACAC AACCACTGCA GTGTGAAGAG 300
TCTCCATCAG ATGTGTGTGT GGGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTTCTTGATG TTGTGTCTGA 360
TTGCTGGAAT CCTCTTCCTC TTCATCAGTT ATTGATCATC AGGATGTATT GACCGGTATC 420
CCAGCATGCT CTAATGGACG AGCAGCTCCA CATCAGGCCG ACCGGAGCCG CTGCACTCCG 480
CTAATGCACA GACCTGCTCT TACCATGCAT AATTCAGCAG CGCGTGTGTG TGTGTGTGTG 540
TGTGTGTGTG TGTGTGTGAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 600
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGGG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT 660
CTCTCCATCC TCCTCTAATG GAATCCTCTA ATGACCGGAG CAGGAAGCAG AAACCATCAC 720
CTGCACTAAT GTGAAGATGA AGATCCGGAG CATTCCTGGA ATGATGGATG TGTGTGTGCG 780
TGAGTGTGTG TGTGTGTGTG CGTGAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGTG 840
AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTCAT TGTGAAGAGA 900
TTTGAATATT AAATAGCTGA TTATCATAAT CATGCGAGGA CAGACGTGCC TTATATGATC 960
GTTTCATGTC ACTGTGTGTG CATGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT TGTGTGTGTG 1020
CTTGTGTGTG AGTATGTACA TGAGTGTGTC TTTGTGTATC AATGAATGTG TGTTTGAGAT 1080
CTCAGTTTGA GCTTGTGCAG ATTCGGCCGT CTTACATGGG AAGTGTTGCT AGGAGACACT 1140
CAGATCCCGC CTTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1200
GTGTGTGCGT GCGTGCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTGGT 1260
GACCATCATC ATAATCCAGC TGCAGTGTGT CGTATCGCTG TCACGGCTGG TGTGTGTGAC 1320
GGTTGTTAGT GTGTCATTGT GAACTGCTGA TTCTGATCCT GCAGTGGAGA AGAAAATAAA 1380
CAAATAAGTG AGGACATTGA GGAGAGGAGG ACAGAGCAGG AGAGATGCAT GATCACTAGA 1440
TGAAGACAGA GCAGAGGAGC AGCAGATTAC TGCGCTAAAC AGACAGTAAA CACACTCGTC 1500
CACTCAGTCT AGAACACACA GTCATCAGCT CCAGCACGCT CATGATGCTG TCCTCAGTCT 1560
TCTGCTCAGC CAGAACCTGC TCGCTATGAT AATCTGTTGC AGATGTGTGT GTTTGCGTGC 1620
GTGTGTGTGT TTTTCTCATT GTCCTTGTTC 1650