EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10095 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:40974353-40975563 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr24:40974384-40974394CCTAATTAAA+6.02
HNF1AMA0046.2chr24:40975463-40975478AATTAATTATTAAAA+6.31
Lhx3MA0135.1chr24:40975462-40975475AAATTAATTATTA+6.25
MIXL1MA0662.1chr24:40975399-40975409TCTAATTAAC+6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr24:40974544-40974561AGCTCACCAAAAGGTCA+6.36
Rarb(var.2)MA0858.1chr24:40974544-40974561AGCTCACCAAAAGGTCA+6.52
Enhancer Sequence
GTTTCGATGA TGTAAGTGGT TAGCATGAGT GCCTAATTAA AGCCTTTACT CTGGATTAAC 60
AGGAGAGCTT CAACATCCTG ACTCTTTTCC TTCAGCTGCC AGCTCCATCT CTTGCAATGA 120
CGAGGTGGAA CATTCCGATC CGCACGCTTC CCTGAGACGC AGGCGCTTCA TTCTCAGCTG 180
TTTGAGCCCT CAGCTCACCA AAAGGTCAAT GACTTGACCC ATTGTGCATC ACCACCATCG 240
AGCAGGCTAT TAATGGAGAC TTGGGGGGGG TCTGTTTGCT TGATTTACTT TGACAAGTGT 300
CCAACTGGGT ATCCCATGAT GCTTTTGCTC CTTTGATTGA GTTACTTGTC ATTTCTTTGG 360
TATCCTTGCT TGGACCAGCT GTGTGATGGA GGCAGAGAGC ACAGGTATTA ATAATGGCAC 420
TATAAAACCG TACTCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 480
ATCTATCTAT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT 540
GTCTGTCCGT CTGTCCGTCC GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC 600
GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC GTCCGTCCGT CTATCTATCT 660
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CCATCTAACA ATCTATCTAT CCATCCATCC 720
ATCCATCCAT CCATCCATCT ATCCATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 780
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCCATCTAA CGATCTATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC 840
ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC 900
ATCCATCCAT CCATCCATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 960
ATCATCTGTC TGTTTGTCTG TCTGTCTGTT TGTCTGTCTG TCTACCTATC TATCTACAGA 1020
ACAAACCACT GTTGTCCAAT GACTTGTCTA ATTAACCTAG ATAAGCATTT AAATGACACT 1080
TTAAGCTGAG TACTATTATG TTGCAAAAGA AATTAATTAT TAAAATTATT ATGTTAAAAA 1140
AATCTATCCA TTAAACAACA ATTTGTAAAT ATTTAAAAGA GAAAAAAAAA TTGCTGGAGG 1200
GCTTAAATGT 1210