EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10059 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:38085066-38087312 
TF binding sites/motifs
Number: 33             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr24:38087266-38087283ATTAATTAATTAATTCA-7.27
ArxMA0874.1chr24:38087267-38087284TTAATTAATTAATTCAT-6.04
ArxMA0874.1chr24:38087266-38087283ATTAATTAATTAATTCA+6.7
DMRT3MA0610.1chr24:38085216-38085227ATTGATACATT-6.62
E2F7MA0758.1chr24:38085240-38085254TTTTGGAGGGAAAC-6.17
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:38085966-38085984CTATCCTTCCTTCTATCC-6.13
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:38085962-38085980CCTTCTATCCTTCCTTCT-6.46
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:38085974-38085992CCTTCTATCCATCCTTCC-6.47
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:38085970-38085988CCTTCCTTCTATCCATCC-6.51
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:38085958-38085976CCATCCTTCTATCCTTCC-6.6
FOXK2MA1103.1chr24:38087121-38087132TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr24:38087121-38087132TTTGTTTACAT-6.14
Lhx3MA0135.1chr24:38087269-38087282AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr24:38087260-38087273TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087264-38087277TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087268-38087281TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087261-38087274AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087265-38087278AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr24:38087262-38087272ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087266-38087276ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087270-38087280ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087262-38087272ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087266-38087276ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087270-38087280ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr24:38086748-38086768TGTTTTGGGTTGTGTTGGGG-7.44
ZNF24MA1124.1chr24:38087277-38087290AATTCATTCATTC+7.22
ZNF24MA1124.1chr24:38087281-38087294CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr24:38087285-38087298CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr24:38087289-38087302CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr24:38087293-38087306CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr24:38087297-38087310CATTCATTCATTC+7.82
ZNF263MA0528.1chr24:38085970-38085991CCTTCCTTCTATCCATCCTTC-6.58
mix-aMA0621.1chr24:38087258-38087269ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
GGAGAGCCGT CGTTGATAAA GTTTGACAGC GCGCTCTTTT TTTTTTCTTC TAGACAACAG 60
AATCTCAGAT GTTGCTCTGT TTTGCGTCTC GTTTTCTGCT TGTTATTCCG TCATTCTTCC 120
TCTGTTGTGC GACTGACTGA CTCTTTTGTC ATTGATACAT TGTAAATCGG TACATTTTGG 180
AGGGAAACCG ATAGCACATC TGTGACACAC ACACACAAAT AGACTGCGCC CTCAGGGTCA 240
AACCCCTGTC TGACCAGACA CAGCTCTTTC TCTCTGTGTG TTTGTGTTTG AGGGTGTGTT 300
TTGCGACAAG AAGTTCCCTC CAAAACTTCT TTTCTCATTC ATGGGTCATC CGCCTTCCCC 360
AGGGCCAAAC ATACACACAC ACAAACACAC ACACACACTC ATGCAGTGTG TGTGTTTTGC 420
CCCCACAGGA GTTGACCACT GCAGACGCGT CGGGGGTGAA ATGCCTTCAC TGCCTCTCCA 480
TCTTAAAAGC GCCCTGAAAA GACGACAAAG TCAAAAAGAG GCTCTTTGTC ACGTTTACAA 540
TGTGGAAGAG TGGAGTCTCC ATTGAGTCCA GCTGTCTGAC TCTGCTGCTG TAAAAGAGAT 600
GATTAACAAA CACAGCAGCA GGCGTTTGTG CTGGACGTTT TGAAGTAAAG ACTGAATTGC 660
AGTGTGCTGT TTATCACTTC ATTAGACAAA GTTTCTCGTT ATTGTATATT GTAGATGACG 720
TGTTTATCAA GCAGTGTGAC ATCACCATGC TTTTTTGCAT TTATCTATCT CTCCATCCAT 780
CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCTC CATCCATCCA TCCACCCATC 840
CATTTATTCT GGTTCTTTGG TTCTCCCATA AGTAAATGGT TGATCCATCC ATCCATCCTT 900
CTATCCTTCC TTCTATCCAT CCTTCCATCC ATCTATTCAT ACAGCTATCC ATCCATCCAT 960
CCATCCATCC ATCCATCCTT CTAGCCATCC ATCCATCCAT TTATCTATTC ATCCATCCAT 1020
CCATCATTCC ATCATCCATC CATCCATCTG TCTGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCATCCATT 1080
CATCCGTCTG TCCGTCCGTC CATCCATCCA TCCATCTATT CTGTTTCTTT GCCTCTCCTG 1140
TAGGTAAATA CCTGATTTTC TCTCAAGATT CAATAAAACT ATAAAATTTT CTGCATTCAG 1200
GCTGTGGAAC ATGTTTAGTT CTAGCTGGTT CTTTTGAAGT GTATTCTTTA ATTCTGAAAC 1260
AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1320
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTCTGTT TGGTTGCTTG 1380
TATCACATTT TGGATGCCAA ATGTATAGCA ATATCAGTAT TTTTTGCCTT TTGAGGATTT 1440
TTTTTTTCAT GAGGAAAAAG TGCCTCATAA ATCATCCATA ATTAAATCTT TAGAAAATAA 1500
ACTTCATCTG AATGTTTTCT GTGAGGGTTG GTTTAGGGTT GGATAAAAGG ACAGTCTGTA 1560
CAGTTTAAAA TTGTTATGGG AAAAAACATG AAAACCAAAT TGTGTGTATG TGTGTGTGTG 1620
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG CACGTGCACA CATGTTTGTT TGACTGTGAG 1680
TGTGTTTTGG GTTGTGTTGG GGGTGTTCTC ATGTTTTGGA GGGAACTCTC TCCACTCATT 1740
GTTGTGAGTG AATCCTGCTG TCTTTGTGTT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1800
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG AGGTGTAGTT ACCTGCAGTG TTTTCTATTT 1860
AATATCATTT AAATCACTTT CCAAATGCTG CGATTACGTG CATGCAAAAA AAGTATTGTA 1920
TTGTCGTGCA TCAAAACATC AGTCTTATGT TGCTTAGCAT TTGTTTAATG ATATAATTGA 1980
ATGATTTTTT TAAACAAAAT AAAATATAAC TGCACCTTTT TTATCCCACA ATTCCCCCCC 2040
CCTCCCCTCA AGAGTTTTGT TTACATCTCT CTCACGATTA AAACTAGCTC AACTACAACA 2100
TGCAAAATCA CGAAATAACG TGAGAATTAA GGTCATAGCT GATATAAATA AAATATAAGA 2160
AATACAACAT GTGAAATAAT GTTTGACGTC ACACTAATTA ATTAATTAAT TAATTCATTC 2220
ATTCATTCAT TCATTCATTC ATTCAT 2246