EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10047 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:36748884-36750669 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr24:36749984-36750001TCAATTAATTAATTATT+6.13
IRF1MA0050.2chr24:36750318-36750339GTCTTCTTTCTGTTTCTGTTC+6.32
Lhx3MA0135.1chr24:36749986-36749999AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:36749989-36750002TAATTAATTATTC+7.12
POU4F1MA0790.1chr24:36749990-36750004AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr24:36749988-36750004TTAATTAATTATTCAT-7.91
POU4F3MA0791.1chr24:36749988-36750004TTAATTAATTATTCAT-8
POU6F1MA0628.1chr24:36749987-36749997ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:36749987-36749997ATTAATTAAT-6.02
SOX21MA0866.1chr24:36750654-36750669AACAATTTCAGTGTA+6.81
Sox11MA0869.1chr24:36750654-36750669AACAATTTCAGTGTA+7.85
Sox1MA0870.1chr24:36750654-36750669AACAATTTCAGTGTA+6.2
Enhancer Sequence
GTCTGCGCTA GAGTAAGTGC TCAAGCTCAT GTGGAGCTGA AACATACAGA ACTGGAGAAC 60
TGCCTTTAAT TCATGAACAG GAAATGTTTT ATTTATCCAT CTATCATTTC TGATTGTCTA 120
TCCCTTCATC CATTTATTTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 180
TCTATCTATC TATCTATCTT TCTATCTATC TATCTATCTA TCTAACTGTC TGTCTGTCTG 240
TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCCGTCCCTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC TGTGCATTTC 300
TGTGTCTAGC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCAT TTCTGTTTAT CTGTGTGTCA 360
CAGTCCATCT TTCTATCTAT CCCATCTATC TGTCCCATTA TCTGTCCATC TATCTATCTA 420
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 480
TCTATCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTGCATT TCTATGTCCA 540
TTCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCCTC CATTCATCCA TCATTTCTGT CTATCTGTGC 600
ATTTCTCTGT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CATTTCTGTC 660
TATCGGTGCA TTTCATTGTC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCATTTCTGT 720
CTATCGGTGC ATTTCTCTGT CCATTCATCC TCCATCCATC CATTTATCTT TCCCTCCATT 780
AAATAATTAT TCATGTCTAT CTGTGCATTT CTCTGTCCAT CCATCTATTC ATCCATCCAT 840
CCATCCATCC ATGCCTCCAT CCATCCATCC ATCCATTCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT 900
CATTTCTGTC TATCTGTTTA TTTCTCTGTC CATTCATCCT CCATCCATCC ATTTATCTTT 960
CCCTCCATTA ATTGTTAATT ATTCATGTCT ATCTGTGCAT TTCTCTGTCC ATCCATCCAT 1020
CCATCCATCC ATCCATCATT TCTGTATATC GGTGCATTTC TCTGTCCATT CATCCATCCA 1080
TCCATCCATT TATCTTTTCC TCAATTAATT AATTATTCAT GTCTATCTGT GCATTTCTCT 1140
GTCATCTATC TATGGATTCT ATCTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTTTGT 1200
CTGTCTGTCA TTTCCTCCCC TCCGTCCCAT CTATAGTATC CATCCTATCC ATCTTTTCTA 1260
TCCCTTTATC CATCCTATCT ATCCCATTCA TGCTTTCCAT CCCTTTTTCC ATCCATCAAT 1320
ACATTCTATC CATCCTTAAT GTCCCTTTAT TTGTCCCATT CATCCATCTT ATCCACCCCA 1380
ACCCTAAAAT TAACGGCACA AGCTTTGTGC TTTTCTCCAG TTGAATTGTG TTCAGTCTTC 1440
TTTCTGTTTC TGTTCCTCCA GATCATTGCT ATCATATCTC TGTTCTTCAT CCTCCTCTCC 1500
ATCATCGCAT TTTCTCTTTG GACTTTGCCC AGCATCAATT CGCACCAATT TCTCAATGCA 1560
TGGGCAAGCA ACTCAACCGA TGATTTTTCC AGGACCCGTC CTCCAGAAGC TCAAGCTCTT 1620
GACGCAGTGG AAATAGTGTG CTCGATATGG TTCGTGTTCG AGTTTGCGAT ACGTGCAGGC 1680
AGCTGTCCAA GCAAACTATG GTTCTTTATT AATGTTATGA ACATTGTCGA CCTGCTGGCT 1740
CTCTTCCCGT GGTTCTTCCG ATGGAGTTCA AACAATTTCA GTGTA 1785