EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10020 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:34508078-34509170 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr24:34509051-34509062TTATTTACATA-6.02
Foxa2MA0047.2chr24:34508360-34508372CCAGAGTAAACA-6.11
Nkx3-2MA0122.3chr24:34509070-34509083TTTAAGTGGTAAA-6.03
ZNF384MA1125.1chr24:34508943-34508955AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr24:34508944-34508956AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr24:34508942-34508954TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr24:34508941-34508953TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr24:34508940-34508952ATTAAAAAAAAA+6.74
ZNF384MA1125.1chr24:34508522-34508534TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
GGATGGGCTA CAGCAACAAA GGATTAAGGC AGTTCTGAAG GCAAAAGGGG GTTGAACCCA 60
GTAATAGTAT GGTGTACCTA ATAAAGTGGC CGATACGTGT ATTTCATACC TTCTGTGATG 120
TTTTCAATGT TAAAATGAGT GTACGAGTAA ATATGTACTT TACTTTGGTC GGTTTTTATT 180
ATGAAATCAT TCATTTAGGC GATCACAGAT GCTTCAGTGA GTCAGTAACA TAAGCAGGAC 240
ACTGTTTGTT AATTTCATGT CAAATAAAGC CTGTATCTGA AACCAGAGTA AACATCTACA 300
CTTAATGTGT TATACTCAGG CTTCATTCAG CATCTGTTGA CTTTAGCTTA TTGAATGTGT 360
GGATTATTTG GATGATTTGT ATGGAAGCCA CTGTCTTTAC AAAACACATG GTGCTGTTTT 420
ATCACGACGG GGATTTTCTT TTTCTTTTTT TTTAAATTCA TTTTCTTCGT ATTAAGCTCT 480
GTTTACAGCA GCAACCACAC AAACACCATT ATTGCTGATG TGCTAAAAGC TTGATTTTGT 540
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT TTGTGTGTTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 660
GTGTGTGTGT GCAATTTACA AAATAATTAT ATATTTGTAA TTAAATAATT TGTCCAACTA 720
TAATTGCACA ATTGCATTAA AGAAACAATG GATTGATAAA CTAATTATAG ACCGTATGTA 780
CAGTATGTAT AAAATATGTT GTCATCACTT ACAAAGGACA GTTCAATATC AAAAGATTAA 840
ACATTTCTAT TATATTATTA TAATTAAAAA AAAAAAAAGC TAAAGGCCAT GTTCGACTCA 900
AAGTACAGTT TAATTTCTAT ATGCACTGGG TCAAGTAGTT AGCAGTCAGC TGCGTTACAC 960
CATGGTGCAT TTGTTATTTA CATAGCAAAC TTTTTAAGTG GTAAAACTGA ACGCTAAACT 1020
AGCGAGAAAA CAGTTAAACA GAGCATCTGC AGCATGAGGA TAAAGAACAA ATTAACGTAG 1080
GAAAAAACAA AT 1092