EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09961 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:28898023-28899459 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr24:28898699-28898716TTGTTTGTTTATTTTAT-6.57
SOX13MA1120.1chr24:28898662-28898673TTCCATTGTTT-6.32
SOX13MA1120.1chr24:28899091-28899102TTCCATTGTTT-6.32
ZNF24MA1124.1chr24:28899336-28899349TCTTCATTCATTC+6.24
ZNF24MA1124.1chr24:28898880-28898893CATTCATTAATTC+6.27
ZNF24MA1124.1chr24:28899262-28899275CGTTCATTCATTC+6.98
Enhancer Sequence
TTGTGAATAA CCATGACAAC CGGAGAGGTC ATGGGGCAGT CGTGGCGTCC ATCCATTCGT 60
CCAGACAGTC TATAGGTGTT CAGGTAGGAG CTGTTTTCTC AGAGACTGAA GTACAGCGAC 120
TCTTTTAGCA AGGGCCAAAC AAACATCATG AATGATGACT CTTGTCTGCT CTCATGGTCT 180
TCAAAATGTA CAAAATGACT GTGGTCCATC CCTGCGGAAA GGGTCACGTC AAGCTGCTGC 240
TGGGACTGGT ATGTTGTGAA AGGAAAGGTG GATTGCAGTG ACGTAAAGCA CTGGAGAGTC 300
AGCAGGGTAA TGTGTGACAG CTGTGGATCT AAAAATAGGC AAAAAGTCTG GCTTAAAACT 360
AGACCTAAAA CTATTCTGTC TATATGGTGC CATCATGACA AAAAACCTGA CTTAAACCTA 420
AAGCTATATT CTGTCAGTTG GTCTATTTAT CGATTGATGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT 480
CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT ATCTATCTAT 540
TGTTTGTTCA TTCTATTGTT TGTTTGTTCT TTTATTCGTT CTACCTATTT CATTTGTTTG 600
TTCTATTGTT TGCTCATTCT AAAGTTCATT CTATCATTCT TCCATTGTTT GTTCATTTTA 660
TTTGTCTTTA ATTATATTGT TTGTTTATTT TATTGTTTGT TCTTTCTATC ATTTGTTCGT 720
TCGTCCTATC ATTTGCCCTA TCATTTGTTC GTTTGTTTTT TCGTTCGTTT TAACTTTGTT 780
CACTTGTTTG GTCTATCGTT CGCTTTGTTC TATCATTCGT TCTCTCGTTC GTTCATTCTA 840
ACGTTTGTTC ATTCTATCAT TCATTAATTC TATTGTTCGT TCAGTCTATT GTTTGTTTGT 900
TCATTCTATC GTTCGTTCAT TATATCTTAT GTCCATTTGT TTGTTTGATC ATATCGTTTA 960
TTCTAACTTT TGTTAATTCT ATCTTTTGTT CATTTTTTTA TTCATTTTAT CTATTGTTCA 1020
TTTGTTTGTT CTATCGTTTG CTCATTCTAT CATTTGTTCT ATCATTTGTT CCATTGTTTG 1080
TTCCTTCTAT TATCGCTCTA TATATTTTAT ATATCAATCT ATCTATTGTT TGTTCTATTC 1140
ATCTGTAGTT CATTTTGTTT TATCCATCCA TCCACCCATC CATCCATCAT TTGTTCTATT 1200
TATATATCGC TTGTTAATTC TATCATTTGT TCATTTTATC GTTCATTCAT TCTTTGTCGT 1260
TTGTTCAATT GTTTGTTCTA TAGTTCTCTT GTTCTATCAT TAGTCTTATA ATTTCTTCAT 1320
TCATTCTATT GTTCATTTGT TATATTGTTT GTTCCATCAT TTTTTATATC CTACTATCTG 1380
TCTATCGTTT GATCTAGCTA TCGTTTTATC TAAGTATCTT TCGATCAAGC TATTGC 1436