EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09960 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:28819508-28821998 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr24:28820549-28820559GTTAATTGGT-6.02
Foxd3MA0041.1chr24:28820561-28820573GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr24:28820783-28820795GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxj3MA0851.1chr24:28820563-28820580TTGTTTGTTTATTTGTT-6.12
Foxj3MA0851.1chr24:28821251-28821268TGGTTTGTTTATTTGTT-6.12
HOXA13MA0650.2chr24:28821403-28821414GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr24:28821403-28821414GTTTTATTGGT-6.32
Hmx2MA0897.1chr24:28820545-28820562ATTTGTTAATTGGTTGG-6.66
Hmx3MA0898.1chr24:28820545-28820562ATTTGTTAATTGGTTGG-6.41
NFYBMA0502.1chr24:28820883-28820898CTGATTGGTTGGTTC-7.05
Enhancer Sequence
GTGCTAAAAG TGACTTTCAT AAGCATAACG AACAGATGAG AAGATTTAGA AATGACTACA 60
GTCCTGGTTG CTCTTCATCA TGAGCATTTG ACCTGAAGTG CAATGGTAAG AGAAGAAGTT 120
TTTTTTCGCA GGCACACATT AAGCCGCCAG CAGCCTCTGT CCAGCAGGGT CTAAACACAC 180
AGAGCCGAAG GGAATATAAA GAGCTCTTTC TGTGTCCGTT CAGATGCAGA GCTCACCGAG 240
AGCTCAGTCC CTCCACATAC AACCTGTGCT CTGTGTTCAA CAAAGAGCTC CCACATCAGC 300
CAACTTCAGC GCTAAAACAA TCGAAAACTC TCAAACGCCA CATTTCTCCG AGGTAGACAT 360
TTCTAGACAG TGGCAGGACT GTAATTCTGA GATCGTAAGG GGGTTATTTT CACTGTGGTC 420
TACCGTGGTG GGTATACCAG AATGAATACT GGTTAAATAG CGCTTCCATT TTAAGAGCGT 480
CTGCGTGTGT ACTGTGCATG GCAGAGGCTG GAGAGCGACT GCTGCTAACT TTATTTGAGT 540
AAATATACAT AATTAACCCA CGCAAGCAGG AAATGGATGG GTTATAAATG CTTGGAGATT 600
TGATGTGATG TCATGAAGTG TTTCAGAAGG CCCTGCTGAA AGAACAACCA TGTTCAAGCA 660
CAATAAATGA AAACATTTGT TATTTTATTA GCAGTTGTCT AAAATACTAT TTGATTAAAA 720
CCTGTATTTT TATAGATAGA TAGGTTGTTA TGTAGATGGG TTTGTTGATT TGTTTGTTCA 780
TTGTTGGTTT GTTGGTTCAT TTGTTGGTTG GTTCGTTGGT TGGCTGGCTG GTTTGTTGGT 840
TTGTTCATTT GTTGGATGGT TCGTTTGTTA GTTCGTTTGT TTGTTCATTG ATTTGTTCGT 900
TCATTGGTTT GTTGGTTGAT TGGTTTATTC GTTGGTTGGT TGGTTGGCTG GTTGGTTCGT 960
TCATTTGTTG GTTGGTTCAT TGGTTCATAT GTTTGTTCAT TGATTTGTTT GTTCATTGTT 1020
GGTTTGTTCA TTGCTTTATT TGTTAATTGG TTGGTTTGTT TGTTTATTTG TTGTCTGGTT 1080
GGTTGGTTTG TTCGTTTGTA CATTGGTTTG TTTGTTCATT GTTGGGTCGT TCATTGGTTT 1140
GTTGGTTCAT TGGTTTATTC GCTGCTTGGT TTGTTAATTT GTTGGTTTGT TTATTGGTTT 1200
GTTTGTTCAT TGTCGGTTTG TTTATTGGTT TGTAGGTTCA TTGGTCTATT CGTCGGTTGG 1260
TTGGTTGACT GGTTGGTTTG TTTGTTTGTT GCTTGATTGG TTTGTTTGTT CATTGTTGGA 1320
TCGTTCGTTG GTTTGTTGGT TCATTGGTTT ATTCGTTGAT TGATTGGTTG TTTGGCTGAT 1380
TGGTTGGTTC TTTGGTTTGT TCATTTGTTG GTTGGTTGGT TTGTTAGTTT GTTTATTGGT 1440
TTGTTAATTT TTTTGTCGGT TCATTGGTTT ATTCGTCGGT TGGTTGGTTG ACTGGTTGGT 1500
TTGTTCATTT GTTGTTTTGT TTGTTGGTTC AGTGGTTGGT TGGCTGGCAG GTTGGTTCAT 1560
TGTTTTTTTT TTTCATTTGT TGTTTGATTT GCTGGTTTGT TGGTTCCTTG ATTCATTTGT 1620
TGGTTATTTG GCTGATTGTT AGCTGGCTGG TTGGCCGGGT GGTTTGTTCA TTTGTTGGTT 1680
GTTTGGTTTG TTGGTTCGTT GGTTCATTCA TTGGTTGGTT AGTTGGTAGG TTGATTCATT 1740
TGTTGGTTTG TTTATTTGTT GGTTTATTCG TTCATTAGTT TGTTTGTTCA TTGCTGGTTG 1800
ATTAATTGGT TTGTTGGTTC GATGGTTCAT TCGTTGGTTG GTTGTTTGGT TGGCTGGTTG 1860
GTTGGTTCAT TGGTTAGTTC GTTTGTTGGT TGGTTGTTTT ATTGGTTTGT TGGTTCATTC 1920
AGTGGTTGGT AGGTTGGTTT GTTCATTTAA TGGTTGGTTG GTTGGTTGGT TTGTTCATTC 1980
ACTTGTTTGT TGGTTCATTC ATTGGTTGGT TGGTTGGTAG GTTGGTTCAT TTGTTGGTTT 2040
GTTCATTCAT TGGTTAGTTG GTTGGTTGCC TGGTTGGTTT GTTCATTTGT TGGTTGGTTG 2100
GTTTGTTGGT TCGTTGGTTC ATTCATTGGT TGGTTGCTTG GTTTGTTCAT TTGTTGGTTG 2160
GTTGAAGTAT GGAAAATATT TGTACAACAT TTATTAAATT TACTTCAGCA TTTACTAAAT 2220
CCAAATTCAT GCTTTTTAAC ATTAATTATT ATCTGTGCAT AAACACAAAC CAATAAGGAA 2280
CAACTGTATT TTCAGTTAAC TAATAACAGT TAATAAACAT GAATGAATAA TGTAATAAAT 2340
GTACTGTTCA TTGTTTGTTC ATGTTATAAA GTACATAAAC TAACATTAAC TAATACAAGT 2400
TTATTGTAAA GTGTTGCTTT TTTATGAAGT TAAAAAAGTT CTATGGGTGT CTTCATGGAA 2460
CCAACCAAGA ACCTTTACAC TTTTAATCAC 2490