EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09768 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:9089923-9090591 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr24:9090131-9090146AGGGGTCAGAGGTCA+9.03
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr24:9090385-9090400TGAACTTTTGACCAC-6.38
Nr2f6MA0677.1chr24:9090132-9090146GGGGTCAGAGGTCA+7.03
RXRBMA0855.1chr24:9090132-9090146GGGGTCAGAGGTCA+7.06
RXRGMA0856.1chr24:9090132-9090146GGGGTCAGAGGTCA+7.01
RarbMA0857.1chr24:9090385-9090401TGAACTTTTGACCACA-6.32
RargMA0859.1chr24:9090384-9090400GTGAACTTTTGACCAC-6.5
RxraMA0512.2chr24:9090132-9090146GGGGTCAGAGGTCA+6.98
Enhancer Sequence
CCAAAACTAA TGACAAAATT GCTAATCCCA GCCTTCATTT AGCTGCTTTC CTGATTTTAA 60
ATACTTTTCA TTCATACTAT TTCCAATTTT ATATTTCCCA ACATGAAACA AATTCACAGA 120
GCTCCAACAT GCTCTTCGCA AAAACTATGC ACACATTTCT GTGCCACACA CAAGTTGGTT 180
GTTTCCCAAC CCCCTTTCAC AGGATACCAG GGGTCAGAGG TCAGACCTGG AGACACAAAG 240
CATAAAGAGA ACAAACCGCA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAAGGAAAGA GAGATAGATG 300
ATAGGTGAGT TGCAGGCAAT TATTAGGCTG TTTAGTCGGC TGGAAAGTCG GTTAGATTAA 360
AATCAGTTGA TGCTAAAATG ACAGTGGGTT TGTTTGGATT CATTTGTGGG GTGTTTCATA 420
GCTTACATGT TGGGTGTGCT GTGCTGTGTT TAAGTCGGGG TGTGAACTTT TGACCACATT 480
CCTTTGTATT TAGATGTAAA TGCGTGAGTG TCAGGCCTCT GACCTCTTGA GATGTACAAG 540
ATCTCGACCT AAAGACCTTC AACTAAAGAC AAACATGCAC GGAAAGTACA CACTTTTCAC 600
AGCTATGGAG TAGTTTAGTT TTAAAGCTTA ACTACTGTTA TTGTGCACTA TTATTGTTGT 660
TGTTTTTA 668