EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09743 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:6533958-6535336 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr24:6535087-6535098CATTGTTTATT+6.02
HNF1AMA0046.2chr24:6534453-6534468ATTTAATAATTAATT-6.39
KLF13MA0657.1chr24:6534873-6534891GAAAAATGGGCGTGGCTA-7.27
KLF14MA0740.1chr24:6534876-6534890AAATGGGCGTGGCT-6.42
Klf12MA0742.1chr24:6534875-6534890AAAATGGGCGTGGCT-6.22
MNX1MA0707.1chr24:6533967-6533977GGTAATTAAA+6.02
MNX1MA0707.1chr24:6534082-6534092GGTAATTAAA+6.02
SP1MA0079.4chr24:6534877-6534892AATGGGCGTGGCTAA-6.94
SP4MA0685.1chr24:6534875-6534892AAAATGGGCGTGGCTAA-7.79
Enhancer Sequence
GGAATGGATG GTAATTAAAG ACTAATGATT GAGTAATTTA ATAAATAATA TGAATAATTC 60
TCATTATAAT GAGTGTTTTT AGATTACTGT GAGGGGTAGG TTTAGGGTTG GGGTGGGAAT 120
GGATGGTAAT TAAAGACTAA TGATTGAGTA ATTTAATAAA TAATATGAAT AATTCTTATT 180
ATAATGAGTG TTTTTAGATA ACTGTGAGGG GTAGGTTTAG GGTTGGGGTG GGAATGGATA 240
ATAATTAAAG ACTAATGATT GAGTAATTTA ATAAATAATA TGAATAATTC TCATTATAAT 300
GAGTGTTTTT AGATTACTGT GAGGGGTAGG TTTAGAGTTG GGGTCGGGAT AGACGTTAAT 360
AACAGGCTAA TTATTGAATA ATTTAATAAA TATAATGAAT AATTCTCATT ATAATAATTG 420
TTTTTAGATT ACTGTGAGGG GTAGGTTTAG GGTTAGGGTG GGGATAGTCA TTTATAAAAT 480
ACTAATCAAT GGGTAATTTA ATAATTAATT GACATAATTC TCATTATAAT GACTGTTTAT 540
TGATTACTGT GAGGGGTAAG TTTAGGATTG GGGTGGGAAT AGACTTTAAT AAAATACAAT 600
TAATGGGTAA TTTAATAAAT AACATAAACA ACATTCTTTA ACTTCTGACC ACAGCTGTAT 660
CCCTTCCAGC AACCCAATCT TTTTTGGCCC ATAGACTTCC ATTTATATCC AACTATATAT 720
ATTTATATAT TTCCAAAGTT TGTTGAACTC TGACTTGTGA AATCACACAT AGTGACATGA 780
TCATGTGAGA CTACAGAACG TGACCTCTCT GTAGAGAAAC TTTAAATAAA TAAATGTTAA 840
ATCGCTTTAT TAAAAGTCAC CATGACACAG TAGGGCGGAG CATGATTTCG TCCTTTGGGA 900
ACCGATTGAA TAGTTGAAAA ATGGGCGTGG CTAACAAAAT ATAAGAAGAT TGACAAACGG 960
ATGAAGGCAG AGCAGAAATG AGAAACGTCC ATGATAGCCC CACCCAAAAA CAATTCCATG 1020
TGACCAGAAG TGAGGAAAAG TCATTTCGAG GAAGGAGAGA AGGTTATGAT ATTTGGTAAA 1080
GGATTATGAG GGCAAATTAA TTTGTACAGA ATAATGAAGT GCTCAGATAC ATTGTTTATT 1140
GCAAGCATTA CTATATATAA TTATACTAAT AAGAGAGTAC ATTTTGATTT CATTCTGACT 1200
TCATGCTCTT GTTTTTTCCC GCCTCTTTTC TGCAGCACCG CTTGACAGAA TTTGGCATGC 1260
TCAAACTCTA GTGTGACCGC GGCTCAATAC AAGCTGCCAA CTGAAGGCGT GTGTTTCACA 1320
TACGGGCAGC ATTTTCTTAA CACTATAATA AATCTGTGCT AGTCTGTGTG AGTCTCAG 1378