EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:4963558-4964664 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr24:4963761-4963771AACAGCTGTC+6.02
Foxa2MA0047.2chr24:4963725-4963737GCTAAGTAAACA-6.52
Foxd3MA0041.1chr24:4964636-4964648AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr24:4964640-4964652AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr24:4964629-4964646AACAAATAAACAAACAA+6.12
NKX2-5MA0063.2chr24:4964522-4964532ACCACTTGAG+6.02
PHOX2AMA0713.1chr24:4963642-4963653TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr24:4963642-4963653TAATTCAATTA+6.14
Enhancer Sequence
TCTCAACACA TCGATTGTGC ATTTTACAGC ATACTTGTGC ATTTTTTTCC ACAAGACACA 60
GGCACTCTTT AGTGTAAAAT AGCGTAATTC AATTACCATA ATTTTTTTTT CTGCAATGTG 120
TTTATCTTGA ATATGCAGGT CTGTAACACA TGCGTCTTTA ATTCGTTGCT AAGTAAACAG 180
CACTAAACCT TTTGTCGGGC CACAACAGCT GTCCGGCCCA CCATTGTACC GAGATAGACT 240
GACCGCAGCC AGCTCAGTGC ACAAGAACAG AGCGGGATGT TCCGACTTCA CCTCCTGCAA 300
CGAAGAGACT GTCAGAAGAG TTTACAATGT CTTAGTAAAA CAACCCTCCA GGAGAACTGA 360
GTGACGGAGA GCTTCGAGTT ATAGGACGGA TGTACACACA AAGGCGAGGG CCGTGTAATC 420
TCTGGTCCAA GTCAACATGA TTTGCATGAG TAGTTTTGGT AATAATATGT AAAGTTAGAC 480
CGAGCCTCAA AAACGGATTC GACATGAAAC TGCTTAGTAA CTAGTTTTGA AACATTGTAC 540
ACCACTTAAT AATGCCTTTC AATTACAAAC AATTTCAAAG ACTAAGTTTA GCAAATGTTT 600
AGAGTTGCGC CACAGAGCAA CGCGCACGTT CAAAATCCCA CATAAACTCA CACTGTAAGT 660
CTTAAATGTG ACAGATCCCG TAATGTTTTA AAAGTTTCAC CCCTGACTTG CAATCCTAAC 720
TTCGCGTTAA AGCAATACTT TACCCAAAAC TGAAAACTCT GTGATCAATA ACTTGCTCCA 780
AACCTGTTAG ACTTCCTTTC ATCTGTTGGA CAGAAAGATG GATATTTTAA GAAAGCTGGA 840
AATCTGTTAC CACCGACTTT TATATTTTTG ATTTTCCTAT TATGTGCATC AATGTTTGCA 900
GCTTTTCAGC TTTCTCCGAA TTATTTAGTG TTCAACAGAA TAAAGAAACT CATAAACGCT 960
TGGGACCACT TGAGGGTGAG TAAACAGTGA GTAAATGCGC ACTTTTGGAT GAACTATCCC 1020
TTTAATGCTT GCGCTAATGT CATTAGGTAG ACCAATAAAC AAACACAAAC AAACAAATAA 1080
ACAAACAAAC AAACACAAAG TGTTTT 1106