EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09719 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:3924175-3925661 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr24:3924617-3924634GTTAGCTAATTAGTGGA+6.54
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:3924635-3924653GAAAGGAAGGATGGATGA+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr24:3924631-3924649GGATGAAAGGAAGGATGG+6.88
GBX1MA0889.1chr24:3924621-3924631GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr24:3924621-3924631GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr24:3924621-3924631GCTAATTAGT-6.02
POU6F2MA0793.1chr24:3924206-3924216ATAATGAGCT-6.02
ZNF384MA1125.1chr24:3925428-3925440TTTTTTTTTACA-6.07
ZNF384MA1125.1chr24:3925315-3925327TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr24:3925317-3925329TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr24:3925316-3925328TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr24:3925318-3925330TTTTTTTTTATA-6.92
Enhancer Sequence
GTTGTTAATG AATAACAAAT AATGAGTTAA AATAATGAGC TATTTGCTAA TTCTTAATAG 60
TTGTTTTTAT AAATTAACAT GTTAAAATAG TCTCATCTTA CAGTAAAGTT AAAATAAAGA 120
CTGTTATCTC TTTTATAGGC CGAGCTTCAC CAGACATGAA GAACAATATC ATACTAAGTG 180
AGCTACTGAG CAAAGATGGA TGGTTGCACG GACGGATAGA TAGACAGACA GACAGACAGA 240
CAGCTAGATA GACAGCTGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGG 300
TGGATGGATG GATGGATGGA TGGGTGGATG GATGGATGGA TGGGTGGATG GATGGGTGGA 360
TGGATGGGTG GGTGGATGGA TGGATGGGTG GGTGGATGGA TGGATGGATG GGTGGGTGGG 420
TGGATGGATG GATTGGTGGA TGGTTAGCTA ATTAGTGGAT GAAAGGAAGG ATGGATGAAT 480
GGATGGATGG GTGGATGGAT GGGCGGATGG ATGGATGGGT GGATGGATGG GTGGATGGAT 540
GGGTGGGTGG GTGGATGGAT GGGTGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGGTGGAT 600
GGATGGATGG ATGGATGGGT GGGTGGGTGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATAGGTGGAT 660
GGATGGATAG ATGGATGGAT GAATAGGTGG ATCGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 720
GGATGAATGG ATGGATTGGT GGATGGATGG ATAGATGGAT TAGTGGATCT ATGGATTAAT 780
GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGTATAG GTCGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 840
GGATGGATGG ATGGATGGAT GGCTGGATGG ATGGCTGGAT GGATGGATGA CTAGCTCAAA 900
AGTGACACTG ATCAGCTATG CGTTTTTTAA CTTGCACCGT AAAAATGCCT GCTCAGCACC 960
TCGCTATGCT GAAGGTGCCT TAAAGACATT GAAAACAGCA GAAAATAAAT GCTCGACTTA 1020
AGAACAAAAA TGTTTCTGTG GACACACAGC CTTAAGGAAT GATATGTTTT TGCACACTCA 1080
AAAAATTGGC TAAATTTGCT AAAACTACCT TTTAGAAATG AGCTGAAACA ACAATTCTTG 1140
TTTTTTTTTT TTATAACTTA ATTGTTTTAC ATTTAATCCA CTGGAAATTG TAAAAACGAA 1200
TCAGTTAACT TAATTCATTG ATGTTGTCCC AGCACAAATC AACTGTGTAG GCATTTTTTT 1260
TTACAGTGTA GTTTGACAAA GCAGTAGGCG GATATGGTTC CAATGAGCCT GCAGAGCAAA 1320
AATGTCCTAT AGTTGGATCT TCACCAACTG CTGTTCAGTT GTGAATCTCT TGCGTCAGCA 1380
AATAAGTTTT CACTTTCATT TCCAGCACAA ACTCCCCTCC CACTTTCACT ATAACAGCAC 1440
GTCACAGATT TGACATGATC AAGGAACCTC CAGTGCCGCA GGGAGA 1486