EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09708 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:2676743-2678702 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr24:2676785-2676796GGTAATAAAAA+6.62
NEUROD2MA0668.1chr24:2678439-2678449ACCATATGGC-6.02
PAX5MA0014.3chr24:2678447-2678459GCGGTCACGCTC-6.07
RFX1MA0509.2chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG+6.22
RFX1MA0509.2chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG-6.23
RFX2MA0600.2chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG-6.44
RFX2MA0600.2chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG+6.53
RFX3MA0798.1chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG-6.14
RFX3MA0798.1chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG+6.57
RFX4MA0799.1chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG+6.17
RFX4MA0799.1chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG-6.46
RFX5MA0510.2chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG-6.35
RFX5MA0510.2chr24:2678675-2678691AGTTGCCATAGCGACG+6.38
RREB1MA0073.1chr24:2678395-2678415CCCCAAACCAAGCACACCAC+6.5
Enhancer Sequence
GTGCTGTGGA GTGTGCTTAA TTGCATTGTA AAAAACATTC ATGGTAATAA AAATCTGTCT 60
TGATTTCCAT TATGCAAAGT ATTTCGTTGG GGCTGAAATG TGATCTGAGC GTTTCTGTGT 120
GAGATTCAGC CATTTATTCG TTCCTGTTCT ACATTACAGC CATTGTCTAT CCTGCTGCTG 180
CTTCTGTAAT ACAAAGGTAC ATTATTTACC AGGCCAATAA AGCACTAGAA GACTGCAACT 240
GAGACAAAGG AGGAAGCAGA GTCTGACTGA AGGAAGGCTG ACTGATTAAA AAACTGCCAG 300
CTCGTCAGAA ACCGAGCATC CTGACAGAAG TGCTGTAATG AGGCCAAAGA CACATGTGCG 360
TATGAAAGAG AGAGCTTTAA GCGGAGCCGG TCACAACTGG CACATGATTT ATTCAGTGCG 420
GGAGGCCAGG AGGGGGGTAT TAAGGATTAA GACTAAGATT GAAAGTGCCA CCTGATCCAG 480
AAAGAGAGCT CAGCTGGTAC CTTCCCCACC TACCAGCCGC CCCACGCTCC CCTGCTATCC 540
CAAAGGCCCC GGGGCGCGTG ACTTGAAGGG CCGTTAATTG TCACCAAACA TGGCTTTAAT 600
CACATTCCCA GGGCCCCCCG TCCTGTGGGG CGTGACTAAA ACCACAACCA CGCCGCTGAC 660
GCGTGCCGTC ATTAACACAG GGTCCCATAT GCTGCGGACA GCCCCGGCGA GGTCCCACAG 720
GGCTCTGTCC TGGGCCCACT GCAAAATTGA TGTGTCCAGG GATTACACGC CGCGCTCTAA 780
TGAATAACTA AGTGGATCCA GCAACAAACC AGTGCCGCAC CGTTACCCCT CCTCCTCCCC 840
TTTCATTAGA GAGAACGACA GACAGACAGA CAGACAGATG GATAGATAGA TAGATGATGA 900
TAGAACAACA GTTAGATGGA ACAATAGGTA GAAAAATAGA ATGGTAGAAC GATAGATATA 960
TAGAACGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATAGA 1020
TGGATAGATG GATAGATGGA TAGATGGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 1080
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GACAGACAGA CAGACAGACA GACGGACGGA 1140
CGGATGGATG GATTTTATGG ATAGATAGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATAGATAG 1200
ATTGAAAGAT AGATGGATAG ATGGAAAGAT AGATAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG 1260
ACCGACCGAC CGACCGACCA ACCGACGGAC GGACGGACGG ACAGATGGAT GGATGGATTT 1320
TATGGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 1380
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATGGGTA GATAGATAGA TAGATGGATG 1440
GATGGATGGA TGGATGGACG GACGGACGGA CGGACGGACG GACAGACAGA AAGATAGACA 1500
GACAGACAGA CAGACAGACG GACGGACGGA CGGACGGACG GACGGACGGA CGGAGGGATG 1560
GATGGATGGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA AATCTCTCTA GTTACCCCAC 1620
CTCCTCCACC CCTTTCATTA GCTAAGCTCC ACCCCCAAAC CAAGCACACC ACCTCTGGCA 1680
CACTTACGCC ACGCTTACCA TATGGCGGTC ACGCTCCGAG GAGAATAAAT AACCTTTCAA 1740
CTTCCCAGGA CGGGGTTTCT CTCTCTCTCT CCCTCTCTCT CTTGTCCCCA TACCCCCAGC 1800
AGCCGCCACA CGTTTAATGC TGTCTTGCTG GCAGCTTTTT ATTGTCCCGC CGTTCTGAAG 1860
AGAAAAGAGG GAATGTGTGA GTGTGGATGG GTGTGTGAAA TAAAGGGGGG GGTGCGAGGA 1920
AACTGAATGA GAAGTTGCCA TAGCGACGGA GCCACACTG 1959