EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09694 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:2141526-2142939 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr24:2141777-2141787TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr24:2141777-2141787TCTAATTAAA+6.02
Foxd3MA0041.1chr24:2142415-2142427AAACAAACAATT-6.22
Foxd3MA0041.1chr24:2142126-2142138AAACAAACAAAC-6.32
GSX1MA0892.1chr24:2142350-2142360CCTAATTAAA+6.02
Hmx3MA0898.1chr24:2142417-2142434ACAAACAATTAAAAATA+6.14
Enhancer Sequence
AAATAAAACT ATATAAACAT GTTATAAAAG AGAAAAACAG CATGTGTGTG GTTAGGTATT 60
TTATTATATT CAGATAATAA AATATAAATA AAATAAATAA ATAATAAATA ATTATTATAT 120
TTAGAGTAAA ATACATTTAT TTCATTTAAC TTATTTTTAA AGAGCAGGCT AAAGAAACTG 180
CAAATTAAAT TGATTTAAAT AAAAACAATA AAATAGTAAA TAATATTAAA TATTTTTAAT 240
AAATAACAAA ATCTAATTAA ATAGATAAAT GTCAAATAAA AAATAACAAA ACAAAAAACA 300
ACAAAATCCA AACCAAATCA AAACAAACAA AAACAAAACA AAATAAAACA AAAAAAACAA 360
CAAAACAAAA CCAAAAACTA ACTAAAAACA GCAAAACCTA CCCAAACAAT AAAACAAAAT 420
AAAACACTAA AAAAAACTAC AAACCAAAAC AAAACTAATA AAAGCAAAAG CAAAAACAAA 480
CCAATTCAAA CCAAAAAACA AACAAAACAA CAAAAAACAA CAAAACAAAA CCAAAACCAA 540
ATAAAAAACA GCAAATCCTA ACAAAACTTA AACACAAACA ACAAAACCCA AACAAAGCAA 600
AAACAAACAA ACAAAAACAG CAAAACCTAA CCAAACAACA AAACAAAATA ACACTAAATA 660
AAAAACAACA AAACAAAACC AAAGCAAAAA CAGACCTAAA CAAAACAAAC TAAAGCAAAA 720
ACAAAAACAT GTCAAATCAA ACCAAACAAA ACAACAAAAA CAAACCAACA AAAACACCCA 780
ACAAAAACAA ACCAAAACAA CAAACAAAAA ACTACAAAAC AAAACCTAAT TAAAAAACAG 840
CAAAACCTAA CCAAACAAAA ACAACAAAAC CCAAACAAAT CAAAAACAAA AACAAACAAT 900
TAAAAATAGA AACAAAAACA AAAAACAACA ACAACAAAAA CTAAACAAAA CAAAATGTGC 960
GGATCCGTCA GCAACATGAT ATTACTGATT GGAATCTCCA TGCATTTAAA TCAATCTATT 1020
ATTTTTGCTT ATAATTAAAA TAATTTTAAA CACAATTTAA AATTAAATTA TTAATTTTTT 1080
GATATTATTA AACCATTTTG TTCCAGAAAA AATATAATAA TAAATGAGAA CTAGTTTGAT 1140
CATCTTATTG TACTGGTGTT GAGTTATGTA TTTTGCAGCA TTACCACATC TAAGCATCAA 1200
CAACAGTGCA CTGAACTTGA ACTCCAGATG TGATCTATAA TTCAGCACTT ACTGTTATCT 1260
CTTCAGAGTA AAAGTTTTCA GACACATTAG TGCTCGTCTT TAATCCAGAG CCCCTCATGT 1320
GTCTCTACAG GGGCCCAGCA GGGTCATTTC CCTGGATGAA CACAGACGCT GAGCTCATTT 1380
CACAATAATT GCTCATCTTC TCCCACAAGT CTT 1413