EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09681 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:1717794-1719341 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx2MA0897.1chr24:1718319-1718336TCAATCAATTAATCAAT+6.14
Hmx2MA0897.1chr24:1718114-1718131CCAATCAATTAATCCAT+6.45
Hmx3MA0898.1chr24:1718114-1718131CCAATCAATTAATCCAT+6.44
Hmx3MA0898.1chr24:1718319-1718336TCAATCAATTAATCAAT+6.45
PBX1MA0070.1chr24:1718356-1718368CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr24:1718571-1718583CAATCAATCAAA+6.18
PHOX2AMA0713.1chr24:1718686-1718697TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr24:1718660-1718671TAATCAAATTA+6.02
PROP1MA0715.1chr24:1718686-1718697TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr24:1718686-1718697TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr24:1718686-1718697TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
GTCAGAGCGT CCAGAGAGCT TTGCTCAGTC TGATAGTTAA CATAAGTCAT GAGGAACGTC 60
TACTAATGCA CACACTCCTT CATCTGTCAC AACCAAAACG CACGGTAAGA GTAATTCTGC 120
TAACCAAACT TTAAAAGAGC AATGCGATGA AAGCATCAAT GAATCTGTTA TTTACATCTG 180
AATGGTTTCA GACATCAGTT TTTGACTGGA TGTAAATATG TGGGCATGGC TCACAAAGAT 240
GAGGTGTATA GGAGTTTAAG CAGAATATAT TATTGGATTT AACAATAATC AAAAATAACA 300
GTTTTTATTT AACATTTAAA CCAATCAATT AATCCATCCA TCCATTCAAC TAACCAACCA 360
TCCATTCATC CAATCAGTCA TAACAATTAA ACCAACCAAG CAAACTAACC AAATAATCAA 420
GTCAGTGAAC CAATCAATAC AAACAACCAA CAAATTAAAT CAACTAAAAA ACTAACCCAT 480
TCATATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATTAATCA 540
ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAAATCAAAC ATCTGTCTGT CCATCTGTAC 600
GCCCGTCAGT CAACCAATCA ATACCACCAA CCAGCCAACC AACCAACCAA TCACACAACC 660
AGCCAATTCA TCTATATCAA TCAATCAATC AACCAATCAA TACAACCAAC CAACCAACCA 720
ATTAAACCAA TTAAACAACA AACAAACCAA CCAACCAATC AACCAACCCA TCCAAAACAA 780
TCAATCAAAT CAAACAACCA ATTAAACCAA TCATTTACCC ATCCATCCCT CCATCCAATC 840
ATATCAATCC AACCATAAAC CACTACTAAT CAAATTAGCT ATTGAACCAA ACTAATTAAA 900
TTAACCAACC AATCAACCCA CCCATCCATC AATACAATAC AACCAACCCA TTCACGCATC 960
CATTCACCCA TTCATCCATC CATTCATATC AATATAACCA TTAACCACTA CCTATCAAAT 1020
TAACCAATGA ACCAAACAAA TTAAATCAAC CAACCAACCA ACCCACCCAT TCATCCATCA 1080
AACTTACAAC CAACCAACCA ATCAACCAAC CCACCCATTC ACTCATCTAT CCATCAACCA 1140
ACCAACCAAC CAACCAACCC ACCCATTCAC TCATCTATCT ATCAACCAAC CAACCAACCA 1200
ACTAAAAAAC CAACCAGCCC ATCCATACGT TCCATCTTGT CTTCCTGTTT GAGTAGAGAT 1260
TATATAGACA TAGGAAATCT AGTTAAATGG CTCAAATGCC CATTTGAAAG CTCTTGGCAG 1320
GATCTCTAAG CTGTTCAAGT CTGTGTCTGG TGCTGAGCTC AGGAAGGTTA ATACTGCAGT 1380
GTAACTGTAG GCAGGGTTTA AGACAGCTCC ACCTCAGGAC AGGTTAGATG GGACTGTCAC 1440
AACCTCATGA TGGAGTTCAA AGCGTCGGGT TTAACCTGAT CTCCATCTCA GAGCTGCAGT 1500
AATCAGAGCC GCGGGAGCTC CGGCGGACGC TAACACACTC ACAGTAT 1547