EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09647 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr24:2-2136 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr24:235-247TAAATAAACAAA+6.18
FOXD2MA0847.2chr24:233-246ATTAAATAAACAA+6.06
FOXE1MA1487.1chr24:232-247AATTAAATAAACAAA+6.29
NFYAMA0060.3chr24:468-479AACCAATCAGA+6.62
NFYBMA0502.1chr24:463-478ACCCTAACCAATCAG+6.23
POU1F1MA0784.1chr24:482-496AATATGCTAATGAG+7.58
POU3F2MA0787.1chr24:483-495ATATGCTAATGA+6.27
POU3F3MA0788.1chr24:482-495AATATGCTAATGA+6.11
RREB1MA0073.1chr24:1635-1655GGGTGGGGGTTGGTTAGGGT-7.36
Enhancer Sequence
TACACTCACC CTAACCCTAA AGTCAGTAAC CCTGACACTA AAACCCCTCT TAATACGACC 60
TGAAATCACA GGAACCATAC CCCAAACACG GGGGACGGCG CGACAAACCC TAACTCGAAT 120
CTTAACACAA AAGTAAATAT ACGAAGGGAC ACAAAAAAGC ACACACACGC ACACATAAAA 180
CAATAAAAAC ACAAATAAAA GACACACACC TAATTTTAAA CAAATAAACA AATTAAATAA 240
ACAAAGTAAT CAAAAAATAA AAAACAAAAA ATAAAACAAT TATTTATTTA TTCACAAAAA 300
ATACATAAAA CAGCATGATA TTCAACAATT AGAAACAGGA GTGGAGGAGG GTCTGGACGA 360
AGGAGGAAGT CGAAATGGAA TCCGAAGCGG TCAGTTGAAA TGTAGGACAA TGCACAACCA 420
AGGCCGGACA CAGTCTGGCC TTTGGATTTT TCGTTCCCCT AACCCTAACC AATCAGATCC 480
AATATGCTAA TGAGGGTGAA ACATAATGAG GGTGAAACTC GTATTGACAC CTATACCTAA 540
CCCTAACCCT GACTCAGTCC AACCTCTGGA TTTTTCTTCA CCCTAACCCT AACGCCACGG 600
GGCGTGGCGG GCAGTTGATG TCGATGGACC GTGCATAACC GGGTTAGGGT TAGGGTTAGG 660
GTTAGGGTTG GATACTGGTT TTAGGGTTAG GGTTAGTAGG GTTAGGGTTA GGGTTAGGGT 720
TAGGGTTAGG GTTAGAGTTA GTAGGGTTAG GGTTAGGGTT AGGGTTAGGA ACTGGTTTTA 780
GGGTTAGGGT TGGTAGGGTT AGGGTTAGTA GGGTTAGTAG GGTTAGTGGG GTTAGGGTTA 840
GGGTTAGGGT TAGGGTTAAT AGGGTTAGAG TTAGGTTTAG GAACTGGTTT TTAGGGTTAG 900
GGTTAGGGTT AGGGTTGGTA GGGTTAGGGT TAGGGTTAGG GTTAATAGGG TTAGGAACTG 960
GTTTTAGGGT TAGAGTTGGT AGGGTTAGGG TTAGTAGGTT TAGTAGGGCT AGTAGGGTTA 1020
AGGTTAGGGT TAGGGTTAAT AGGGTTAGAG TTAGGGTTAG GAACTGGTTT TAGGGTTGAG 1080
TTTGAGAGAA GGGTTAGGAT TAGTCAATTT TCCTTCAATG CTTTAAGAAA TTATTTGTTG 1140
CTCTGAGAAG TTAGTTTAGC ATTGGTTAAG AAACCCTTGT AGTTAGTTTA AGGTCTAAGA 1200
CAGTGGTATA TTTTGGTCTA CAAAAAAAGT AGATGAAGAG GATTCAAAAT GCTGGTTAAG 1260
ACCATGCAAG AAAGAACTGA ACATTGAACA ATCTTGGTGA AATATCCATC GTTGGTGTAG 1320
ATGGGAATAA AAATGATGAT TCAAGTGACA TAGTATCCAA GTAGATGACA TCGATCCAAG 1380
ATAAGGCTAG TGTTCGAAGA GAGAGAGAGA AAGGATGGTT AAACTGATTA GAGTTTTCAA 1440
AGATTGCACT AAGGAAATCC AGATGACCAA GATGTAGATA CAAATGAAAC CATGATGCAA 1500
ATGAAAGATG CAATAGATGA TCTGACATTA AAATATCCAT ATAATCAAAC TCCTTTTGGT 1560
TGGGTTAGAG CGGTTTCAAT TTATAAAACG TATGAACATG ATCCAAATAC ATGCCAAGCT 1620
TACTGTTGTT TAGGGGTGGG GGTTGGTTAG GGTTGTTTCA TCCGCATTAA TTTTAGTTAC 1680
TGCCGATGTT AGGCCATATT TGCTGCTATA TATTTTTCTA CATGACAGTT CAGAAAGAGG 1740
AACCTAAGGA TGTTAGACCT TTTTAGGCCA TGCACTCCAG CCTTTCTGGG CTTCAGGTTC 1800
ACACACCAGT CTTGAGTCCA TCCACAGTCC ATATGGGACA GGACACAGAG GTGAGCAAAG 1860
AGTTAGTTAA TTTTTAGGTT AAGATTAAAT TGCCATTTCA TTCTCCCCTT TATATAGATC 1920
TAAGCTTTAT CTAAACTCAT TTAAAAGCAA AGCAAAAAAA ACTTGTGGTT ACATGTAGGG 1980
GTCAAGGCAA TATTCCAGTC CAGAAAAAGT AGATGCAACA TTCAAAATGC TGGGTAATAA 2040
AGATGATCAA AGTTTAGTTT GATTGCTTAA TTCATCCCTA CTTTTTGAAT TAGTTCCTAA 2100
AATTTACAAT AGCAGTCACC AAGCCTCTTT AAAA 2134