EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09621 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:44989410-44990406 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr23:44990242-44990257GTGACCTTTGACCTC-6.04
HNF4GMA0484.1chr23:44990243-44990258TGACCTTTGACCTCT-7.22
NR2C2MA0504.1chr23:44990243-44990258TGACCTTTGACCTCT-8.25
NR2F1MA0017.2chr23:44990246-44990259CCTTTGACCTCTG-6.74
Nr2f6MA0677.1chr23:44990243-44990257TGACCTTTGACCTC-8.42
RXRBMA0855.1chr23:44990243-44990257TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr23:44990243-44990257TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr23:44990243-44990257TGACCTTTGACCTC-8.12
ZSCAN4MA1155.1chr23:44989971-44989986TACACACACTTACAA+6.33
Enhancer Sequence
TTCACTTCAC TTAATATGCA CAGATGTGTG TTATTTACTG ATTATTCTAC CCATATGGGA 60
GCTGTGTCAG TGCTTATCAC TGTGGCCTCA CAACAAGAAG GTCTCTGGTT TGAGTCTCGG 120
CTGGGTCAGT TGGTGTTTCT GTGTGGAGTT TGCATGTTNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 180
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNAA TACACACACA CACATATTCT CTCATACAGC ATTTGGCACA 300
AAAAAAACAC ACTCACAAAT GCTCACACAA ACACACTTAT AAACACACAC ACACACATAC 360
ACAGTATCAG TCACACAAAC ACTTACAAAC TCACACTCAC ACAGCATGTC ACACAAACAC 420
TCTTAAAAAC ACATACACAC ACACACACCG TATTAGTCAC ACAAGCACAG ACAGCATCAA 480
TCACACGAAC ACACTTATAA ACGCACACAG ACACACAAAC ACAAACACAC ACACACACAC 540
ACAGCATCAG TCACACTCAC ATACACACAC TTACAAACAC ACACACCCAC TCACACATAT 600
ATATAGCATC ACACGCACAC ACACACACAC ACACAGCATC AGTGACACAA GTGCAGATGT 660
ACACACAACA TCCTGCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTCTGT GTGTGAGAGT GTGTGTTGCT 720
GCAGTATGTT CACTGCTTCT GCTGTGCAAA AACAACTCCA CTTCCAGGAA GAGCCACACA 780
CACACACACA CACACACATG AAGCAGGTGT GTTTGCCTGT ATTCATCAGT GTGTGACCTT 840
TGACCTCTGC TCTTCTGTAA CTGAAGCTCA GCTCATTGCA GTATTCATTA TTTCTGCACA 900
CACACACACA CACGTACACA CACACACACA CAGCTGTGAA TCTGCTCAAA CACACACCTT 960
CAGTTGGAGA CGTGTGGTGT AACCCGTGGA GTTGAT 996