EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09616 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:44610018-44611732 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CLOCKMA0819.1chr23:44611370-44611380AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr23:44611370-44611380AACACGTGTT-6.02
GATA2MA0036.3chr23:44611713-44611724TTCTTATCTCT+6.32
Gata1MA0035.3chr23:44611713-44611724TTCTTATCTCT+6.32
Gata4MA0482.1chr23:44611714-44611725TCTTATCTCTC+6.32
HNF4A(var.2)MA1494.1chr23:44611550-44611565TTGACCTTTGACCCC-6.01
HNF4GMA0484.1chr23:44611551-44611566TGACCTTTGACCCCG-6.32
NR2C2MA0504.1chr23:44611551-44611566TGACCTTTGACCCCG-8.18
NR2F1MA0017.2chr23:44611547-44611560CGTTTGACCTTTG-6.57
NR2F2MA1111.1chr23:44611549-44611560TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr23:44611544-44611558TGACGTTTGACCTT-6.2
Nr2f6MA0677.1chr23:44611551-44611565TGACCTTTGACCCC-7.95
RREB1MA0073.1chr23:44611416-44611436TGTGTGTGTGTGTGTTGTGT-6.19
RXRBMA0855.1chr23:44611544-44611558TGACGTTTGACCTT-6.03
RXRBMA0855.1chr23:44611551-44611565TGACCTTTGACCCC-8.42
RXRGMA0856.1chr23:44611551-44611565TGACCTTTGACCCC-8.42
RxraMA0512.2chr23:44611544-44611558TGACGTTTGACCTT-6.01
RxraMA0512.2chr23:44611551-44611565TGACCTTTGACCCC-8.42
Enhancer Sequence
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTCAGGGAGT GTTTACACTG CTAGTCTATA 60
AAAGATGCTG CTTACATTTG AGGGGAAAGT CCAACCACAT TTGAGCTGTT CAGTAAACAC 120
ACATCGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 180
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGAGAG AGAGCTGATG TCATTGCTCA 240
CTGAGACACA CATAGACACA CAAACACATA CATACACACA CGTACACACA AGCACATAAA 300
CTCATACATT CACTCACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACATA 360
ACACAGGCAC TCACTTACAC AAATTAATAC ACACATATGC ACTTAAACGT TCACACTTGC 420
ATACACACAT TCACTCACAG ACACTCAGAC ACACACACAC AAATACGCAC TCACATTCAT 480
ACACATTCAT TCACACTTAC ACAAACTGAA CACACATTCA TAAATACACA AACACACACA 540
CACACACACA CACAAATGAT CAGTTACACA CATTTACACA CTACACACAA ATACACACAC 600
ACACACACTG TACACACATG AACTAACACA CACTCACTCA CATTCACAAA TACTGTACAC 660
ACACACACAC ACAACCACAT AGGCTTACTC ATTCACAAAT ACACGTACCC ACACACACAC 720
ATACTGTACA CACATGCACT CTCTCACACA TACACATATT CACACACATA TTCTCACACA 780
CACATACACA TTCACACACA CACAAACACA TATAGACACT CACACACTTT CAAACACACA 840
CAATTACACA CACACTCACA AACACATACT CTTACACACA CACACAAACA AACACAAATA 900
GGCACTCACA CACATTTATA CACACAAACA CACACTCACT CGTACTCACA CACATTCATA 960
CACACATACA CACGGAAACA CATGCAAATA CACAAACACA CACACACACA CATACATATT 1020
CATACACACA TACACACACA CACACACACA CACACACACA TACATATTCA TATACACAGA 1080
CACACACTCA CTCACAAATA CGTACTCACA CACATCTGTA CAAACACACT CAAACATTTA 1140
CACACACACA TAACCACATT TACACACACA CACGAATACT GTACACACAC CTACTCACAC 1200
ACATGCATAT ACACACACAC ACACAACAAC AACATTCTCT CACTTACATA CACAAATACA 1260
CATACCCAAA TGCACACACA CACACACACA CTGGGCGTGT TGGCAGGGGT TGAAACAGAT 1320
GAGTGTTGGG AATGGTCTTC TGTATGAGTG TAAACACGTG TTTCAGCTGC ATCTGCTTAG 1380
CTGGAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTGTGTGT GTGATTGATG TAAATATGCT 1440
CATAGCGTCA GGGCAGATCC TCATACAGTA ACCCCCGCAG CAGTACTCAT CATCAGTGTG 1500
TGGAGGAGAT CTTTTCTTGG CTCTCCTGAC GTTTGACCTT TGACCCCGGC AGGGAGGGAC 1560
TTGAGCTCAT GCATCCTGTC GGGCGTCACG GCAGCAGTTT TCACTTCCTG CTGCTCACTT 1620
CCTGTGTCTG ACACACACAC ACACACACTC ACAGACGAAC ACACACTCCC CAGATCCATC 1680
AGGAGCATTT GTCTCTTCTT ATCTCTCTGC CTCA 1714