EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09606 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:44355535-44356758 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr23:44355754-44355766GTCTGTTTACAT-6.44
FOXP2MA0593.1chr23:44355755-44355766TCTGTTTACAT-6.02
IRF1MA0050.2chr23:44356295-44356316ATAACAAAAGTAAAAGTAATA-6.35
Enhancer Sequence
CAGGGGTCGC AATCCAATAG AACAATAAGC TACTATAGTA ACTATAAACG ACTATTTTTT 60
TTCTCTTGAG TAGGTTGTGA ATAAATTATG GTAAATCTTA TGGTTCAATA AAAATAAATA 120
GATTTTTGAA AGTCACCAGG CGACCCCTCT TCATTGTCCC GCGACCCCTC CCGACCCCCA 180
CTTTGAGATC TACTGATCTA TTCTACAGTA AACAAGCCCG TCTGTTTACA TTCATTCAAC 240
TTTGGGTCCC TAGCGGCTCC TAGTGGCGAG ACTGAATTAC TACAGGTGCA TTTTAAAAAC 300
TCTCCATCTA TTCAAAAACT TACTACACAT TAAAACTATT GAAACATTAC GCAATTATTT 360
CATCATAGAG TTTACACACA CGTGTATGCT GATGACCAAA TAATTATCCC ACAAGTGAAG 420
TTTGAATTTT ATTTCAAATA TTCAAAGAAG TGCTGCTGTT TAAAGCAGAT GCATCTAGTC 480
TACTACTACT GATACTACTA CACCAACAAC GACTACTATT ACTACAACAA CACCTTTACT 540
ACTTCTGATA CCACTATGCC AATGACATCC ACTACTACAG GAACTTCTAC ACCTACTACT 600
TCAATAATCA CAACTACAAT CGATACTACT ACAATGACTA CTACTACTAC TGCTACCTAC 660
TACAACAACG ACATCAACCT TATTAATGAC AATGGTATAT ATACTTATAA TAATGAGGAG 720
GACAGGAGGA CAAGTCAAAA CAGTAATAAT AATTATAATG ATAACAAAAG TAAAAGTAAT 780
ACCATTCATG ATAAAAGTGA GGAGGTGAGG GGAGGACTAA TAATAATAAT AATAATGATG 840
ATAATAATAA TAATAGTAGT AGAAGAGGAA AGAGAAGAAA ATAAGGCTAA GATAAAAAAT 900
TAGCTAAAAA CAGAAAAGGG GAGGAATAGA AGAAAAAGAA AGGAAGAAAA GGGTTGAAAA 960
ATAAAGTGCA GCAAACAAAA CAATGAGAAT AATAATAAAA AAACGACTAT AATAATGATA 1020
ATTACGAATT GTACAAACCC AAAGTAAAGA ATAATATTAA AAAGAAGAAT GTAACTAACA 1080
GTATGATGGA TTATTAATAA CGTGATGACT ATAATATACT CATGCTGGTA ATAATAAAAA 1140
ATACTAATAA TAAAACAACA ACAGCTTTAA CAATAATTTG TGGAGGTGGA AGTTTTATGA 1200
TCAGCATGTT TTAATGTCTT TGC 1223