EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09605 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:44336877-44339666 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr23:44338623-44338634GTTTTATTGGC-6.14
HOXB13MA0901.2chr23:44338623-44338634GTTTTATTGGC-6.14
HOXD13MA0909.2chr23:44338623-44338634GTTTTATTGGC-6.14
Enhancer Sequence
CTATTTTCTT TCTCTTAATG ACGCGCACTG TTTAATTGTT CACCACAAAA CTAGCAGTGT 60
GAGCTAACCT AAGCTAATAT GGCTAGTTGT GATGTCACCT GTACTTTTTA ACGCCGCGTC 120
AGTCTCTCCA CATGGCAACA GCCGCTGTCG GTCTCCATGG CAACTGCTCT ACAGTTGCTA 180
GAGCAACAAC AGCCCCGCTG TCAAGGCAAC CGCAGTCAGC CAGCCAGCTT CGCTCATGTT 240
TCCACGCGCG TGTCGTGCTG TTGTTCGCGT CCCCGCAGCC GTCTGTCTCT CCCGCGCGAG 300
CTGCGAGACG GGCGCGCGAC AGAGAGAGAG CGAGCGCGCG CGCGAGGAGA GGAGGCTCGA 360
CAGGCGGAGG GACAGACCGG GGAGGGTGGG GGGGATTCAG CGCGTCTGTC GCCCCTCAGT 420
CCTGACATGG ACTGCCTGTG TATAGTGACC ACTAAGGTAA GACTGCTGCG GCCCGCGTGT 480
GTATGTGTGC ATGCCAGTGT GTGTGTGTGT GTGCGTGTGC GCGCGCGCGA TGTGTCTAAA 540
TACTGCAGCG TTCTCTCACG CGCCCGCGTA CAACACCGCT GCCGTCTCGC GCTCGCGTCT 600
CATTATACAG CTGTGTGTGT GTGTGTAGCA TCATATCTCA CTTTATATAA CACACACTGT 660
GAGTGTGTGT GAGTGTGAGT TCTGCCGGTC CAAAAACAGT TTCTGCTCTG AAGAACAAGC 720
AGGTGTGTGA GATGCTTTAA TGTGTGTGTG TTTTAAATAT TGACTGTGGT TTACACCTGT 780
TTTGGGTGTG TGTCTGTGTG TGTTTGTGTT GTGGTCCTTT TTTTAATGTG TGAATGTGTG 840
TGTTTTAAAT ATTGGCAGTG ATTTACACCC ATTTCAAGTG TGTGTGATTG TGTGTGTGTG 900
TGTGTGTGTG AGAGAGAGTG AGTTCTGGTC CTTAAACTGT TTTAGTCTGT TTTAAAGTGA 960
TTTACACCTG TTTGGTGTGT GTGTGTGTGT TCTTCTGGTT TTCTCTCTGT GTGTGTGTGT 1020
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTCT 1080
GTGTGTGTCT GTGTGTGTCT TTTAAAAACG GGCAGTGATT TACACCCGTT TCATGTTTGT 1140
GTGTGTGTGT GTTTATGTTT TAGTGTGTTA ATGTGTGTGT TTTAAATATC GGCAGTGATA 1200
TACACCTGTT TCGTGTGTGT TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1260
GTGTGTTCGT TCGTCCATGT TTTCGTGTGT TAATGTCTGT GTTTTAAATA TTGGCAGTGA 1320
TATACACCTG TTTCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TCGTCCATGT 1380
TTTCGTGTGT TAATGTGTGT GTTTTAAATA CCGGCAGTGA TATACACCTG TTTCGTGTGT 1440
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTTTGTCCAT GTTTTAGTGT GTTAATGTGT 1500
GTGTTTTAAA TATTGGCAGT GATATACACC GGTTTCGTTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1560
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTC GTCCATGTTT TAGTGTGTTA ATGTGTGTGT 1620
TTTAAATATT GGCAGTGATA TACACCGGTT TCGTTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1680
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGCGT CCATGTTTTA GTGTGTTAAT 1740
GTCTGTGTTT TATTGGCAGT GATTTACACC CCTTTCATGT TTGTGTGTGT GTGTGTGTTT 1800
ATGTTTTAGT GTGTTAATGT GTGTGTTTTA AATATCGGCA GTGATATACA CCTGTTTCGT 1860
GTGTGTTTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTCGT TCATCCATGT TTTCGTGTGT TAATGTCTGT 1920
GTTTTAAATA CTGTCAGTGA TATACACCTG TTTCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1980
TCGTCCATGT TTTCGTGTGT TAATGTCTGT GTTTTAAATA CNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2040
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2100
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NGTTCTGTTC CTTAAACTGT TTTAGTGTGT GTTTTTAAAG 2160
TGATTTACAC TTGTTGTGTG TGTGTGTTCT TTTGGTGTTT TAGTGTCTGT ATGTGTGTGT 2220
GTGTTAAATA TCGGCAGTGA TTTACACCCG TTTTGTGTGT GTGTGTCTGC GCGTGTGAGA 2280
GAGTTCTTCT GGTTTTCAAA CTGTTTTAGG GTGTGTTTTT AAATACTGGC AGCGATTTAC 2340
ACCTGTTTTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 2400
TGTGTTTGGC CTGTTCATCA GGTGTATGCT GATGACTTAT GAAGTTGTTA ATGGTCTTCT 2460
CTTTGCTGCT GTTCAGTTGT GATGATCTTC ATGTTCAGTT CAATACTCAC TCCAAGCTTT 2520
CTGACTTTCT TTATCCTCGT TTAAGGCGTC GCTGTGGAAT CAGATTAGCT GTTTCCTCTT 2580
TATATATGGA ACAATGAAGT GTTTATTATG ACTAATTATC ATTTTAAGTT GACCTGTTTT 2640
GTAATCTTGA ATCAGAATAT CTTCCCTGCC CTCTTCATTG CTCAGCTCTG ATTGGTGTTT 2700
ACTTGTCTGA GGGGGCGGGA TCAGCTTTGC TGATGCTAAG ATCCACCAAT AGAAGAAGAC 2760
AAAATTAGAA GATTGTTGGA ATTATTAAT 2789