EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09604 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:44311051-44313334 
TF binding sites/motifs
Number: 59             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:44312491-44312508TCAATTAATTAATTAAT-6.13
Alx1MA0854.1chr23:44312506-44312523ATTAATTAATTAATTCT+7.2
ArxMA0874.1chr23:44312506-44312523ATTAATTAATTAATTCT-6.26
ArxMA0874.1chr23:44311667-44311684ATCAATTAATTAAATCA-6.27
ArxMA0874.1chr23:44312490-44312507ATCAATTAATTAATTAA-6.2
ArxMA0874.1chr23:44311390-44311407TCAATTAATTAATGTCG+6.48
ArxMA0874.1chr23:44312491-44312508TCAATTAATTAATTAAT+6.73
Hmx1MA0896.1chr23:44312835-44312852CCAACCAATTAATCAAT-6.09
Hmx2MA0897.1chr23:44312835-44312852CCAACCAATTAATCAAT-6.93
Hmx3MA0898.1chr23:44311386-44311403TGAATCAATTAATTAAT-6.03
Hmx3MA0898.1chr23:44312487-44312504TCAATCAATTAATTAAT-6.45
Hmx3MA0898.1chr23:44312835-44312852CCAACCAATTAATCAAT-6.72
LMX1BMA0703.2chr23:44311672-44311683TTAATTAAATC+6.02
Lhx3MA0135.1chr23:44312509-44312522AATTAATTAATTC+6.29
Lhx3MA0135.1chr23:44312493-44312506AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312497-44312510AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312501-44312514AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312505-44312518AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312496-44312509TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312500-44312513TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312504-44312517TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:44312508-44312521TAATTAATTAATT-6.78
ONECUT2MA0756.1chr23:44312036-44312050AATAAATCAATAAA-6.29
ONECUT2MA0756.1chr23:44312044-44312058AATAAATCAATAAA-6.29
ONECUT2MA0756.1chr23:44312052-44312066AATAAATCAATAAA-6.29
ONECUT2MA0756.1chr23:44312060-44312074AATAAATCAATAAA-6.29
ONECUT2MA0756.1chr23:44312252-44312266AATAAATCAATAAA-6.29
ONECUT3MA0757.1chr23:44312036-44312050AATAAATCAATAAA-6.71
ONECUT3MA0757.1chr23:44312044-44312058AATAAATCAATAAA-6.71
ONECUT3MA0757.1chr23:44312052-44312066AATAAATCAATAAA-6.71
ONECUT3MA0757.1chr23:44312060-44312074AATAAATCAATAAA-6.71
ONECUT3MA0757.1chr23:44312252-44312266AATAAATCAATAAA-6.71
PBX1MA0070.1chr23:44313024-44313036CAATCAATCAAA-6.18
POU6F1MA0628.1chr23:44311393-44311403ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44311588-44311598ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312494-44312504ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312498-44312508ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312502-44312512ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312506-44312516ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312510-44312520ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44311393-44311403ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44311588-44311598ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312494-44312504ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312498-44312508ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312502-44312512ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312506-44312516ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:44312510-44312520ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr23:44311379-44311392AAATGAATGAATC+6.04
ZNF24MA1124.1chr23:44312768-44312781CATTCATCCATTC-6.19
ZNF24MA1124.1chr23:44312728-44312741CATCCATTCATTC-6.44
ZNF24MA1124.1chr23:44312764-44312777CATTCATTCATCC-7.04
ZNF24MA1124.1chr23:44312732-44312745CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312736-44312749CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312740-44312753CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312744-44312757CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312748-44312761CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312752-44312765CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312756-44312769CATTCATTCATTC-7.82
ZNF24MA1124.1chr23:44312760-44312773CATTCATTCATTC-7.82
Enhancer Sequence
TGGTTCTCTG CCAGGTAGAA CTTATCCTCG TCTGTCCGCT TGATCTGATA ATGCCTCACC 60
TCACCTTTAC CTGAACTGAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCTATCTAT 120
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAACCAAC 180
CAGTCAGTCA GTCAGTCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT 240
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCT ATCAGTCTAT 300
CAAATCTATC AAATTAGTGT CAATCAATAA ATGAATGAAT CAATTAATTA ATGTCGATCA 360
ACCAATCAAT AAATGAACTA AAGTCAAACT ATTAAACTAT CAAACTATCA GTTAGTTAAC 420
CAACAATCAA CCAACAAACA AACCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC 480
AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAACT ATAAAATCAA TCATTCAATT 540
AATTAATCAA AGCAACTATC CATCCATCTA TTCATCCAAC CAACCAATCA ATCAATGATT 600
TGAGTAGTGT TGCCAAATCA ATTAATTAAA TCAATGTCAA TATATCGCTC AGCCAATCAA 660
CCAACCAATT ATAGTCTACA ATCAACCATC CATCCATCCA ACCAGCCAAT GAATCAATCA 720
ATTAGTGTTG ACCAATCAAA CTAATCACTG TCAAACTATC AGTCAATCAA TCTATCGCTC 780
AACCAACCGA CCGACCAACC AACCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC 840
AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATTCATC 900
AAAGTAACTA ACCATCCAAC CACCGATCCA TCCAGCCAGC CAGCCATCTA GCTATCCATC 960
CAACCAACCA ACCAACCAAC CAACCAATAA ATCAATAAAT CAATAAATCA ATAAATCAAT 1020
AAATCAATCA ATTAGCGTTG CTCGATCAAT CAATTAAATC AATTATAATC TATCAGGTAA 1080
CCAATCAACC AACCAATCAA AGTATCCAAC CAACCAACCA ACCATTCATC CATGCATCCA 1140
ACCATCCATT CATCTATCTA TCCAACCAAC CAATCAACGA GTCAATCAAT TAGTGTTGAT 1200
AAATAAATCA ATAAATCGGT TTATCAAAGT AACCAACCAT CCAACCACTG ATCCATCCAG 1260
CCAGCCATCT AACTATCCAT CTAACTATCC ACCCAACCAA CCAACCAATC AATCAATCAA 1320
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AGTCAGTCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 1380
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 1440
TCAATTAATT AATTAATTAA TTAATTAATT CTTCAAAGTA ACCAACCATC CAACCACCGA 1500
TCCATCTATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCAATCA 1560
ATGATTCAAT CAATTAGCGA AGCCCAATTA ATCACTTAAA TCAATCTTTC AGTCAACCAA 1620
TCAACCACCC ATGCACCCAA CCATTCAACC ATCCATTCAT CCAACCATGC ATCCAACCAT 1680
CCATTCATTC ATTCATTCAT TCATTCATTC ATTCATTCAT TCATCCATTC ATCCATCCAT 1740
TAATCCATCC ATCAAACCAA TCGACAGACC GACCGACCAA CCAACCAACC AATTAATCAA 1800
TCAATTAGTG TTGCNCAATC AATCAATTAA ATCAATGTCA ATCTATCAGT CAAGCAAACT 1860
ATTGCTCAAC TAATCAACCA ACCAATCAAA GAATCCAACA AAGCATCCAT CCATCCATCC 1920
ATCCATCCAT CCAACCAATC AATCAATCAA TGAGTCAATC AATTAATGTT GACCAATCAA 1980
TCAAATCAAT GTCAAACTAT CAGTCAACAA ATAATCAATT AATCAAAATC AATGTCAATT 2040
TATTAGCCAA TCATTCTTAA TGTCGATCAA TCAATCAGTC AATAAATCAT TCTATCAGTC 2100
AGTTAATCGA TCAATGGATC AGTGGAGGGA ATCAGTGAAA TGATCAATCA AAGAGGCTTT 2160
ATTACCAGTG TGTGTAAACA GACACTGTGT ATGTGCTGGG CTGACTGGAG CTCCTGACCA 2220
CAAACCCTCC ATCCTTCCCC TGTTAAAAAA ACACACACAC AATGAATGGG CCATTTTGAG 2280
CAT 2283