EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09599 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:44133300-44135697 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr23:44133505-44133515AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr23:44133505-44133515AGCAGCTGCT-6.02
Foxd3MA0041.1chr23:44135409-44135421AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:44135413-44135425AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:44135417-44135429AAACAAACAAAC-6.32
Myod1MA0499.1chr23:44133505-44133518AGCAGCTGCTCCT+6.11
RREB1MA0073.1chr23:44134216-44134236CCCCCCCCCACACACTCACA+6.07
RREB1MA0073.1chr23:44134607-44134627CCCCAATCCACCCCCCCACA+8.16
RREB1MA0073.1chr23:44135046-44135066CCCCAATCCACCCCCCCACA+8.16
RREB1MA0073.1chr23:44134205-44134225CCCCAATCCACCCCCCCCCC+8.46
ZNF740MA0753.2chr23:44134214-44134227ACCCCCCCCCCAC+6.32
ZNF740MA0753.2chr23:44134212-44134225CCACCCCCCCCCC+6.44
Enhancer Sequence
CCCTGCAGGG ACACCGGCCC TCCAGGACCA GGATTGGTGA CCCCTGCTTT AAACTCACAC 60
ACTACACACT CAAAGATGAA CATATCAGCT TTTTTGTTCA CCTTAAAACG AATGATGTGC 120
GCCAGGAAAA TAAACATGGT GCATTTTGAT TCCACGCTGC AGCCTTTAAA TGCAGTAAGG 180
GTCAGATGTT GGGTCAGTAG GGGACAGCAG CTGCTCCTCT GAGTGTGTTT GACCTCGCGA 240
GTGTTTACAC TACAGCACTA ATGTTATTAT AAGACTGAAG ATCATGATCC TTTTTAAAAC 300
ACTGAGGAGA TCTGCTGCTC CTGAGTTAGT ATATTTCACT GAGTGACGTC CTGTTAAACG 360
TGTGAAAGTC TAGATACTGG TGTGCTGTGG AGGTTAGTTT GGGGAGTAAA GAGTAAACTG 420
TTGATGTCAT CGTGAGGATT CAGGTGAACT GCTTTAAACT TAATACTATA AAAATCTGAA 480
AAGTCTAATC TCATTTATTT AAACATATGA TCAAGAACAT ACTCCCAAAT CCACACACAC 540
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTT 600
TTCATAAACA TTCATACTCT CACATGCACA CTCTTGCTAT TTCTTTCACT CTCAAGCACA 660
GCTCACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACATACAA CTCTCAAACG TACTCGCATA 720
CATACATAAA TACACACCTA TCTCACATAC ACTTATATGC TCTTGATATC TAACACACAC 780
ACACACATAT ACAACTCTCA AACACACACT CTCACTATCT TCACACTCAC ACACAATTTA 840
TTAAATTCAC ACACACTTTC TCTCTCTCTC TCTCACACAC ACACACACAT GAACAGGAAA 900
ATACTCCCCA ATCCACCCCC CCCCCACACA CTCACAAAAA CGACACATAA ACGCACACAA 960
ACAAGAAAAA CACACACACA CACTTTTCAT AAACATTTAT ACTCTCACAT GCACACTCTT 1020
GCTATTTCTG TCACTCTCTC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT ATACAACTCT 1080
CAAACATACT CGCATACATA CATACACACA CAACTATCGC ACATACACTT ACATGCTCTT 1140
AATATCTAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACATATAC 1200
AACTCTCAAA CACACACTCT CACTATCTTC ACACTCACAC ACAATTCATT AAATTCACAC 1260
ACACTTTCTC TCTCTCTCAC ACACACACAC ACTAACAAGA AAATACTCCC CAATCCACCC 1320
CCCCACACAC TCACACAAAC GACACATACA CACACAAACA AGAAAAACAC ACACACACAC 1380
ACACACACAC ACACACACAA GCACACACAC ACACACACAC TTTTCATAAA CATTTATACT 1440
CTCACATGCA CACTTGCTAT TTCTGTCACT CTCTCTCACA CACACACACA CACACACACA 1500
CACACACACA CACACTCACA CACACACAAC TCTCAAACAT ACTCGCATAC ATACATACAC 1560
ACACAACTAT CGCACATACA CTTACATGCT CTTAATATCT AACACACACA CACACATATA 1620
CAACTCTCAA ACACACTCTC TCACTATCTT CACACTCACA CACAATTCAT TAAATTCACA 1680
CACACTTTCT CTCTCTCTCT CTCACACACA CACACACACA CACACACACA CGAACAAGAA 1740
AATACTCCCC AATCCACCCC CCCACACACT CACACAAACG ACACATAAAC ACACACAAAC 1800
AAGAAAAACA CACACACACA CACTTTTCAT AAACATTCAT ACTCTCACAT GCACACTTGC 1860
TATTTCTGTC ACTCTCACAC ACATAGCTCT CTCTCTCTAT CTCACACACA CACACATACA 1920
ACTCTCAAAC ATACTCGCAT GCATACATAA ATACACACCT ATCTCACATA CACTTACATA 1980
CTCTTGATAT CTGACACACA CACAATTGCA CACACATATA CATTTCTCAA ACACACACTC 2040
GCTATCTCTC TTCTCACTCA CACACAATTC TTTAAATTCA CACACACTTT CTCTCACACA 2100
CACACACACA AACAAACAAA CAAACAAACA GTCTTTCTCT TTTTCAATTC AAATGCGTTT 2160
TAATGTATAC GGCTTGTGAA GGATTACCAA AGCATTGCAC ATTACATACA AATGAAAACT 2220
CACCGGCCAC TTTATTAGGT ACACCTCTCC TACTGCTTGT TAACGCAAAT TTCTAATCAG 2280
CCAATCACGT GGCAGCAGCT CAGTGCATTT AGGCATGTAG ACATGGTCAA GACGATCTGC 2340
TGCAGTTCAA AGCGAGCATC AGAATGGGGA AGAAAGGGGA TTTAAGAGAC TCCGAAT 2397