EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09594 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:43840931-43842293 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr23:43842043-43842055TTTGTTTACATT-6.37
FOXK2MA1103.1chr23:43842043-43842054TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr23:43842043-43842054TTTGTTTACAT-6.14
Foxj3MA0851.1chr23:43842040-43842057GGGTTTGTTTACATTCT-7.93
ZNF410MA0752.1chr23:43841175-43841192GGAGATTATGGGATGTA-6.93
Enhancer Sequence
GTGTAAACGG TTGAAAACTC TGTTATTGTG TTAATTAAAG TAAACGCGCT CACACACACA 60
TTTACGCATG CTGTTGCGAA GGTGTGTTCT GATGTCTGAT GTTGTGACAG ACTGCTATTG 120
GTCGATTGAA CAGATTGTCC CGCCCTTAAG CTCATGCTAT TGGCTGATTC AGAGGGCAGA 180
ATTCGCTGTC AGGCGGCTCA GTAAAGCAGA TCAGTGTGTG TGAGTGTGTT ATTCCTCAAC 240
AGGAGGAGAT TATGGGATGT ATCTGCAGTA TAAATGTTCA TTAGTTCTGG AGAGATGTGC 300
AGATTCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACCAAA GAAGCTAATA TCTGTGTGTG TGTGTGTGAG CAGGGCTGTG AAAGGCTGGC 420
CTGGTTCCCG ATGCTCGCTG CGCCTGCAGC CAGAGGAAGC TCTATTGTTG ATCCGCTCTG 480
GAATTCAGCC CGGAATGCAG AGCTCAGAAC AATGAGGAGA CTCAGACACA GACTTCACAC 540
CTGAACAACT ACTGCACCGT TACACACACA CACACACACA CATACATATA TACACACACA 600
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CATAAATACA TATATATACA 660
CAAACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACAAATACA 720
TATATACACA AACACACAGA TACACACATA AACACACACA CACACACACA CACAAACACA 780
CATATATACA CACATAAACA CAAAAAGACA CACACACACA CACACACACA CATAAATACA 840
TATATATACA CAAACACACA CATACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 900
CACACACACA TAAATACATA TATATATAAA CAAACACACA GATACACACA CACGCACACA 960
CACACACACA CGCACACGCA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1020
CACACACACA CACACAGCCC AAAAAAGGTA ATAACTGATC ATTTTCCTCA GCAATAATCA 1080
TCTAAAGATG TGAGTTTGAT TCAGATCAGG GGTTTGTTTA CATTCTGTTC TCCAATATGG 1140
CCGACTGATG AAACCCTCTA TAGCGGTGTT TCTCAACCAC GCTCCTGGAG GCCCACCAGC 1200
ACTGCATGTT TTGGGTGTCT CCTTTGTCTG TCACAGCCCT TACAGGTCTT TGTCCCTGCT 1260
AATGAGCTGA TGACCTGAAT CAGGTGTGTT TGGTTAAGGA GAAATGTGCA GAGCCGGTGG 1320
TCCTCCAGGA ACGTGGTTGA GAGACACTGC TCTACAGTGC CG 1362