EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09593 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:43798349-43800177 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr23:43799906-43799925CCTCCAGCAGAGGGAGCTG+6.07
PBX1MA0070.1chr23:43799589-43799601AATGATTGATGG-6.07
PBX1MA0070.1chr23:43799813-43799825ATTGATTGATGG-6.62
TFAP4MA0691.1chr23:43800142-43800152ATCAGCTGTT-6.02
Enhancer Sequence
TCAGCTCAAA CACACACACA CACACACACA CTTTAGTGAC TGCAGAGATG CATTTATAGC 60
TTGTCAAAAG GGGCAGAATA GGTCTCCTTT AATGATTAAG ATTTGCTTGA GAGGATCAGA 120
CTATGAAATG TGTTGTGTTG TGTTTTATTG TGTTGTGTTT TGTGTTGTGT TTGTGTTGTG 180
TTGTGCAGGA TTATCCTGAA GACGAGCTCC TGCTGGTGTT TGACAGAGAC TTCATCTACG 240
GTCAGAGCTT CTACCTGGTG CTCACAGTCC AGGCCAAGGA GAGCATACTG AAGGTGAAGA 300
CACGCTGCAG ACCTGANNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 360
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNTAGA 420
TGGATGGGTA GATGGATGAA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATAGA 480
TGAATAGATA GATGCATATA ACAACAGATG AAACAGTGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 540
AAATGATGGA TGAATGGATA GACAGAACAA CTGATTGAAA AGTGGATGAA TGGATGGATG 600
GATGAATAAG AAAGTGGATA AATAGAGGAT AGATAGAATG ATGGACTGAG TGATTGATGG 660
AACAGTGGAT GGGTGAACAA TGGAGAGATG GATGGATGGA TAGACAGAAC AACTGATAGA 720
ACAGTGGATG GATGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGTTGAATGA GAAGGTGGAT 780
AAATAGAGGA CGGATGGATG AAAGGACAGA ATGGTGAATG GATGGATGGA TGGATGGATG 840
GGTAGATGGA TGGATGGATG GATAGATGGA TGGGTAGATG GATGAATGGA TGGATGGATG 900
GATGGATAGA TGGATGGGTA GATGGATGAA TGGATGGATG GATGGATAGA CAGAACAACT 960
GATAGAACAG TGGATGGATG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGTTGAAT GAGAAGGTGG 1020
ATAAATAGAG GACGGATGGA TGAAAGGACA GAATGGTGAA TGGAAGAATG GGTGGGAAAG 1080
TGGATGTTAG AACGATAGAG GGAACAAATG ATTGGTGAAC AATGGAAAAA TAGATAGATA 1140
GATAGATAGA TAGATGGATA GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TAAGAATATG 1200
GAGAAATACA GGATGGATGA AGGGATAGAA TGATGGATTG AATGATTGAT GGAACAGTGA 1260
ATGGGGAAAC AATGATGAAT GGATAAATAA AACAACTGAT GGCATAGTGG ATGGATGGAT 1320
GGATGGATGG ATGGATGGAT GAATAAGTAA ATGGATAAAT AGGAGATGGA TGGATTAATG 1380
GATAGAACGA TGAATGGAAT AATTGATGGA ACAGTGGATG GATGGAAAGA TAGACCGCTG 1440
GATTAATGTT AGATGGACTG ATGGATTGAT TGATGGATGT ACTGCCGGAT TGATGAGTAG 1500
ATGGAAAGAG TGATGACTGT ACAGAATAAT AGATGTCCTG TATGTCTGTG TCTCCAGCCT 1560
CCAGCAGAGG GAGCTGATGA GCAGATGGAG GATGAAGAAC AGCAGGAGGA AGAGGAGGAG 1620
ATGATGACGA AGACTCCAGA GCCTCAGCCG TGGGTGTCTC TGGGCAGTGA ACAGGNNNNN 1680
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1740
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNAGGTT TAGTGTATAC TCCATCAGCT 1800
GTTTTAAGTT CTGTCATCTG TGTGCGTC 1828