EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09587 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:43174411-43175987 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr23:43175590-43175603GAATTAATTATTT+6.22
NR2C2MA0504.1chr23:43175737-43175752TGAACTCTGACCTGC-6.16
POU4F1MA0790.1chr23:43175591-43175605AATTAATTATTTAG-6.07
Enhancer Sequence
TATAAAATTT GTAAAATAAA CATTTGCAGG TTAAAGAAAC AGCATAGGAG GGGCCTTGGT 60
GCAGATGAAA AGTTTAAAAA GTGTATTTGT ATATAGAGAG ACATGGGTAA CTAGATAGAA 120
TAGACAGAGA TAGGTTGATC TCAGCAGCAG CTGCCGAAGA GCTGCGCGCT GCAGACGCAG 180
CTGGTGTGAA AGGCAAACGC CTGCGTGCTG CTACTGCTCG ACATACGCGC TGCTCACGCT 240
CTGCTCACGC GCCGCTGACG CTTGCGGTGT GAAACAGGCG TAATCTGTCA TTTAAGGCGG 300
AGCTATCTGT CCTTTAAAAC AGGGCTGTCA GTCATTCGGG GGTGGAGTTA TCTGCCCTTA 360
AAGGCGGGGC TTTATGTAAT TTAGGGCAAG GCAATTAGTC ATTTAGGGTG GAGATATCCG 420
TCCTTTAAGA CAGGGCTGTC AGTCTTTTAA GGTGGAGCTG TCTGTCTCTA AGGGCAGAGC 480
TTTCTGCAAA TTAGGGCGGG GATATGTGTC ATTTAGGGTG GAGCTATCTG TCTTTTAGAA 540
CAGGGCTATC AGTCATTTAG GATCAAGCTG GCTTTGCTTA ATGGTAGGGT TTTTAGTAAT 600
TTAAGGTTGG GCAATCAGTC ATTTATGGTG GAGCTATCTG TCCTTTAAAA CAGGGCTATC 660
AGTCATTTAG GGGCGGAGCT ATCTGTCATT AAGGGCAGGG CTTTAAGTAA ATTAGGGTGG 720
GCCAATCAGT CATTTAGGGT AGAGCTCTCA GTCTTGTAGG ATAGGGCTAT CAATCATTTA 780
GGGTGGAGCT TTCTGTCCTT AAAGGTGAGG CTTTCAGTAA TTTAGGGCTG GGCAATCAGT 840
CATTTAGGGT GGAGCTATCT GTCTTTTAGG ACAGGGCTAT CAGTCATTTA GGGTGGAGCT 900
GTCTTTGATT ACCGGTAGGG CTTTCAGTAA TTTAGGGGTG GGGCCATCAG TCATTTAGGG 960
CAGAGCTATC TGTCCTTTGA AACGAGGTAA TCAGTCATTT GGGGGCGGAG CTATCTGTCC 1020
TTAAGGGCGG GGCTATCAGT CATTTAGGGG CAAGCTGTCT GTCCTTAAAG GCGGCACTTT 1080
CAGTAATTTA GGGTGGGACA ATCAGTCATT TAGGGCGGAG CTATTTGTCT TTTAGGTTGG 1140
GGCTTTTAGT CTTTTAGGGT GGAGCTGTTT AGGGCAAAGG AATTAATTAT TTAGGGCGGA 1200
AATATCTGTC CTTTAAGTTG CGGTCACACT GCACTTTCAT TCATACGCAC ATGATTGCGT 1260
CAGACCAGAA ACGCAAGGTC GTGCGTCAAG TTTCACAGTT CACTGCTTTG CAAAGTTCAA 1320
GCTTTGTGAA CTCTGACCTG CAAAATCACA TCACTTGACT GTGTGAGACC AATCCAGGAC 1380
CAAAACATGA CCTCTCTGGA CAGAAATTTG AAATATGGAG CAATTACTTA ATTTTTTAAA 1440
TGTCTATTTA TTTTGTTTAA TCCCGCCCCT TTTCGCAGCG CTGTACGACA GAATGTCGCA 1500
AGCTCAAATT CCACAGCTTT AGCTTTTTTG TGTGACCACA GCTTTAGGAC AGGGCAATCA 1560
GTCATTTAGG GCGGAG 1576