EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09585 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:42983354-42984494 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr23:42984208-42984219ATATTAATTAT+6.02
BHLHE41MA0636.1chr23:42984400-42984410GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr23:42984400-42984410GTCACGTGAC-6.02
DUX4MA0468.1chr23:42983584-42983595TAATTCAATCA+6.14
DUXAMA0884.1chr23:42983583-42983596CTAATTCAATCAA+6.07
MITFMA0620.2chr23:42984396-42984414CTCAGTCACGTGACCTAA+6.73
MITFMA0620.2chr23:42984396-42984414CTCAGTCACGTGACCTAA-6.74
POU4F1MA0790.1chr23:42984209-42984223TATTAATTATTCAT-7.25
POU4F2MA0683.1chr23:42984207-42984223TATATTAATTATTCAT-6
POU4F3MA0791.1chr23:42984207-42984223TATATTAATTATTCAT-6.64
USF1MA0093.2chr23:42984400-42984411GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr23:42984398-42984414CAGTCACGTGACCTAA-6.26
Enhancer Sequence
CAACACATTG AAACCAGCCT TTGTGTGATC AGATTCGGAT CTCACACGTG CAATGTAAAC 60
CTGGCAGCGC TTAAAAAGCC ATAAAGCACA ATTTCTCCAT CAAAGAGCCT CTGTAAACAT 120
CAGCTGTCAT GTTTAGGTTA GTGTTGTCAT GTTTTGCCTG TCTAGACAGA CGCATGAACG 180
TAAACACACC TCCACACGCC ACCATAACAT GCTAACGACA GCTAACCTGC TAATTCAATC 240
AAAACAGCAC CAAATCACAC TCTAAAGGGA TTAACGGAAG TGAATTCTGA CGCTTAAGCC 300
TGTCATTATC TGATGTGTTA TTATTGACTT CCTCTAACCC CGAGCACATG CCAAAACCAG 360
CGTCTCGAGG CGATGCGCGC GCGTTTGCTC GTTCCCGCGC GCGCGTGCCC ACTCGGCGAA 420
ACAAAAATCC ACACACCTTT TCCTCTTCCT CTGTGTGTGA GGCGATCACC GTCGATGCCG 480
TACTTCCATT ACGTCGCATA AAACCGACTG AAACGAGTGT GTTTTGTCGT TCTCTGTTGT 540
TTCGCTGTGA TATCGTTTCC GTTCGGCGGA TCCACCGTCC ACGTCTCGAG GAGTCGAGGA 600
AAAAGAAGCG ATCCGGTAAT CCGCTTTCAG GACGCGGGAT TGGAGAGAGA CGCGCTCTAG 660
GCGTTTACTC TCTGCGCTCT GATTGGCGAG AGGGCGGAGC GGAAGCGCTT GACGCGGTCC 720
AATCAGAATC GATATTTGTG CGTCACACAG AATCCCCACG TGCGCGCGCG CGCTCTCTGT 780
GCCTCAGCTT CACATTAGCC GTGGTTGTTG CTAGAAGGAA TACAGCCGCG GACGGAAATT 840
AACAAGAATT ATTTATATTA ATTATTCATT TACCAATTAA TTGTATTTTG TTGACGTCTA 900
TCCCTTCCCT AATCCTAAAC TAAACCATTA CAGTAATGTA AAAATACTAA TTATTGTTGT 960
ACAGTGTCAC AAAACAAATC TATTTTGATG TGAGTATCCG CAGCTGTATC TCTTCTAAGT 1020
TTTATGGTCA GCCGGGCTGT GGCTCAGTCA CGTGACCTAA GAGCGCGCCA GACCAGGGGG 1080
AGTTCATTGT GAAAACTCAC AGCAAATCTA CTTTTCATGT CGTTTGGTAA CTGAATTAAT 1140