EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09556 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:40756726-40757640 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr23:40757470-40757482TTTGTTTATTTA-6.18
FOXC2MA0846.1chr23:40757515-40757527TTTGTTTATTTA-6.18
Foxd3MA0041.1chr23:40757510-40757522GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr23:40757598-40757610GATTGTTTATTT+6.62
Foxj3MA0851.1chr23:40757512-40757529TTGTTTGTTTATTTATT-6.03
PBX1MA0070.1chr23:40757591-40757603TTTGATTGATTG-6.18
PHOX2AMA0713.1chr23:40757430-40757441TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr23:40757430-40757441TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr23:40757430-40757441TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr23:40757430-40757441TAATTTAATTA+6.62
ZNF24MA1124.1chr23:40756900-40756913GAATGAATGGATG-6.44
ZNF24MA1124.1chr23:40756896-40756909AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
GGTCGCTATA GGTGAATTTG ATTAACTAAA CTGGCTGTAC TGTGTGTGTG TGGATGAGTG 60
TGTATGGGTG TTTCCCACTA CTGGGTTGTG GCTGGAAGGG CATCATACAG AATGCTAGAA 120
TAGTTGGCGG TTCATTTGGT GGTTTAACCC CTGATCAATT GGACGAAGGA AAATGAATGA 180
ATGGATGGCT CTTTAAGGAT TGAAATCTGT GATCCTTGTC TTTTCTCTCA GTAATGATAT 240
TTGAAATGTC CTGGAAAATG ATCTGTAATG TATGACGGAT GGATAAACAT GACGGCGAGG 300
TGTTAGACGA GGGATAAACA GATGGACAAA CAGAAAGACG GAGCGAGGGA GAGTGTGAAG 360
CAGATGGATG GAGAGGGTGA GAGGCAAACA GCTGAGAGGA GAAGACGAGG AAAACACAGA 420
TGGACATGGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 480
GTGTGTGTGT GTGTTTGTGT GTGTTTGTGT GTCTGTGTGT GTAGGTGAGC AGGAAAATCT 540
AAAGAATGGT TATGTCACTG CTCAAACTAC ATCTGCTGTG TGTGGATAAA GAGATCTTGC 600
CCACATTAGA AGCTGTTGTG TCTAAAACTT CACTACTTTT CTTATCATTA GTAATCGGCA 660
GTGTTGGGGA ATAAGGAAAC TACTTTTTAA ATTATTAGAC ACTTTAATTT AATTATTTTA 720
TTTATTTATT AGTTTATTTA TTAGTTTGTT TATTTATTTA TTTGTTTTTT TAGTTTATTT 780
AGTTGTTTGT TTGTTTATTT ATTTGTTTGT TTATACAGTT GTTGTTTTTT GGTTATTCGT 840
TTATTTATTA ACACATTTGT TTTTTTTTGA TTGATTGTTT ATTTCTTATT TATTTATTTA 900
TTTATTTGTT TTTA 914