EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09463 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:35223413-35224474 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr23:35223435-35223447AAACAAACAAAC-6.32
Lhx3MA0135.1chr23:35224333-35224346AACTAATTAATTT-6.29
NFYAMA0060.3chr23:35223569-35223580TCTGATTGGCT-6.32
mix-aMA0621.1chr23:35224334-35224345ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
GCTTTTTTGT TGCTCAACAA TAAAACAAAC AAACAAAACG ACTGAAGTTT ATTTATTTAT 60
TTATTATTGC GAATTGTACT CTGACTTTTT CTTTGTCCCG CCTTCCTGTT GTTTTTCTGT 120
TATTCCATAG GCTCTCATAC TGGCGTGATC CCTTGTTCTG ATTGGCTGCT GGTCTCGGAG 180
GCCTGTATAT AAGGGAGCTT CCGGCAGGGT TCGGAGAGCT CATTTCTGTG CATTCGGTGT 240
TTGAAGTGGA GCTCCTGGGT TTCCCTCACC CCTCCGACCG ACGACCAACA ACCAATATTG 300
TACTGATGTT CATCATACGT TAAAATATTT TGAGAGTGTA GGGGTGGCCT GCCTATTTAT 360
TTGATTACTT TTGACTATGT TTATGTTTAG GGTGTAAGGT AAGCTTTTTT GTATTGTTCT 420
TTAAATAGTA ATAGGTAATT TAGTGCATTT ACTTTATAGA TTCTTTCGTT TGTTATTTTG 480
GCCTGTGGTC ACCCTGAAGA GATGCTCATT TATATTAACC ACATTTTTCA ATAATAAATC 540
TTTTCATATA TACTCTCAAT TGAGTGTGTG AGTTTGGTTG TCGACCGAAG GGAATCTTTT 600
GCCTTTTGTT TTGTTTGGGA AATCCACCAC CCCAACACAT TTGTTTTCCT TCGTTTATTA 660
TGCCCTTGTT GTTTCCCCTA GACTTGGGGC ATAATAGTTA CATTGAAATA GAAATGAAAA 720
TCTCTGTTAA AGAGATTCCC CAACCCTCCC CAATCATTTT CCTCTGGTGG GCCGAATCAA 780
ATGATACAAA GGGCCAACTT TGACCTGCGG CCCCTAGTTC TAATTTCTGA TTTAGATCCT 840
CATTAGTCAC TAAGGTAGGG GCTATTATTT CCGGGGGGCT ATAAATTATT ATGTTAACGT 900
TGAATTTTAA ATGCTAGCTA AACTAATTAA TTTGAGACAA TATTTAATAA AAGTTTTTAA 960
AAATTCATTA ATAGCTTTAA AATCTTTAAT AAATTAGTAA AAATGTATGC ATGAACTTCT 1020
ATTTAATAAG ATGCTAAGGA ACTTATTTAA GGGCGTACTC G 1061