EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09354 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:25233212-25234342 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:25233535-25233553CACTCCATCCTTCCTTCC-7.16
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:25233543-25233561CCTTCCTTCCTTCCTTTT-7.95
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:25233539-25233557CCATCCTTCCTTCCTTCC-9.55
GATA5MA0766.2chr23:25233846-25233856TCCTTATCTG-6.02
Gata1MA0035.3chr23:25233846-25233857TCCTTATCTGT+6.14
PBX3MA1114.1chr23:25233673-25233690CCGGCTGTCACTCACAC-7.1
ZNF263MA0528.1chr23:25233916-25233937CTTTCCTGTCCCCCCTCCTCC-7.95
Enhancer Sequence
TCTTAAAAAA AATATATATA TATATTTCAC GGGACTTTTA AAAATATTAA TTTTGGGAAA 60
AAAATTAAAT AATTATGTAC CTTTACACTA CTAAATGCCA CCCCTCCTCC TCCGCTTCAT 120
CAGCCAAATG TATGTTCGCG AAACATTTGC GATGTTCAAT TCATAATCAT TTGTGTGGTG 180
TTGCTTACAG GTCATTTATG ATATATTCTA CTACGCTACA CTGTTCCTTT TAGAAGACAG 240
AAAACTGAAA CCTCTTTGTC AACAAAATGC ACTCACTATT TGTTTTGCCA AAGCTATTTA 300
CAATTGAAAC ATTGTGTGAC ACTCACTCCA TCCTTCCTTC CTTCCTTTTA TTTATTGCTC 360
CGGCAGATCT GATCATACTC ATGCTATCCT CCACACCTCT TCCACTCCCA CATGGCCAAA 420
CTTCAGTTGG TTTTGTTGTG GTGGAATTTT GTCCATTGTC ACCGGCTGTC ACTCACACCA 480
GCACATATTT TATCTCGGGA AAATCTCTCC AACTCTTTTT GTGTGCGTGT GTGTGTGTGC 540
GTGTGTATGT GCACGACCCC CTCCTCCATT ATCTCCCTCT CTTGTTCTCA TTCACACACA 600
TTTTTCCCAC CCATTTCAAC ACAAACCCCC TCCTTCCTTA TCTGTCTCCC TCCCTGACTG 660
GCTGTCTAAA ACCTTGATGT CCTCTCTCTC TCTTACCCAC AATCCTTTCC TGTCCCCCCT 720
CCTCCATTTT ATCCACACTT TTTTTCATCA GCTTCATCAT AGCTCAACCC CCCAAAATCT 780
TTCTGTCTGC CCCCTCTCGA AACACACACA CACACACACA CACACACATA CACTACGTTC 840
CCTGGCTCCC TCTTTGTCTG CCTCAGTAAA TCAGCAGAGC CTGCTCAGTT CCAGGGGATT 900
AATGTGTGTA TGCTGGTGAA GAGAGCAATG AAAAAACTAG GAGAGGCAGA GAGGGCTCGA 960
TTTTTGTGTA GCGCCTGTTG TGTTTGGAGT TTTAGAGCTC TGTGGGAGCG GAGTTTGTCC 1020
GAGGAAGAGA AAGTCAGAGT GCTTTAACAA AACGGTGCGC TGATTAGCTC TACCGTTGTT 1080
GAAGAAGAGC TTGGATGTGA GGTGATATCC GACATATGTG AAGCTCCTTG 1130