EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09347 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:24639929-24641629 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr23:24640474-24640484GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr23:24640474-24640484GTCACGTGAC-6.02
LMX1BMA0703.2chr23:24640031-24640042TTAATTAAAAT-6.62
MITFMA0620.2chr23:24640470-24640488GTATGTCACGTGACCTTC+7.31
MITFMA0620.2chr23:24640470-24640488GTATGTCACGTGACCTTC-7.31
PBX2MA1113.1chr23:24641113-24641125GCTGTCAATCAA-6.32
STAT3MA0144.2chr23:24640298-24640309CTTCCCAGAAG-6.14
USF1MA0093.2chr23:24640474-24640485GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr23:24640472-24640488ATGTCACGTGACCTTC-6.02
Enhancer Sequence
ACAATTTTAA TTGTTTAAAA ATGGGTTAAA TGATCCCGGA CGAGCCCCCA AAAATGTTAC 60
AAACCCCTGA TGTTAGTCTA GGGTGTGGGG TTTGACATTT ATTTAATTAA AATATATTTG 120
TATAAACAGT GAATGAGTGG GAAGACAACC AAAGTAATGC CAAAAAATGT GTGCTTTTAT 180
TTACAATCCC AAAGTGAACA ACAACAACGA ATTAATCAAA AATAAAGAAA AAGTAAGTAA 240
AGCAAAAATA TATTATTTAC AATATGTACA ACACTGAAAC AAATAAAGAC GGGGAAAACA 300
AGAGAGCTGG CAGAAGGGAC GCGGGCGGCG CTAAAGAAAT GAAAAGAACA AAACCCAAAC 360
TAAATCTAAC TTCCCAGAAG CATCTAGCTA ACTAACTATG TGAAAAACAG TATAATTAAC 420
ACACGAAGAT CTTCCGAGCC CTAACTATCT ACTCTATCTA TCTATTCAAA AAGTACAAGG 480
AGTGGCGCTC GCCCCTAACC TAATGTACTA GACAGCAGAG TAGTCCTGAG TGTTGCGAAA 540
TGTATGTCAC GTGACCTTCT TACCTGTCCG CTTCGTCCAA GCCTCGTAAA CAACGATAAA 600
CTAAGAACAA TGTACGAATA ACGGACGGAT AACGTGCACA CAGAAACAAG CAACAACAAA 660
ACACAGTTAG ACGGGGTTAT TTCTAAACGC ACGCGGTAAA TACAAACAAG CGACAAACAG 720
CAAAAGAGAA AATGCAAGCA AGAGAGCAAG AAAACAAGAA AGAGCGAGTG GTCTGGCGCG 780
CGCTTTTAAG ACGGGTGGTC TTTGCTCATT GGATGTGACG TAAGAGTGAC GTAACCGGGG 840
AGGAATGACT GACAGCTGAA TGGACCAATG AACAGAACCT GAGAATACAT GAGAGCAGAT 900
ACGGGAGAAC AGAGCGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGGG AAAAAACACA GAGAAAACAG 960
AGCACAAAAA ACACAAATAC ATAACAATGA TAAAATGCTG TAATTTATTA CAAATATGCA 1020
CTGTTTTAAA AACGTTTTCA ATTTGTAAAA CTCATTCCTG ATCACATTTG ATGATGACTG 1080
ATGATCACAG CGAGCTGAGC AGATCTTTTA AACCCATTGC TTTGCGCACG TCCTGTCTTG 1140
TTGATATGAT TATACGCATT ACTATGGAGA CATGTTAATA CATGGCTGTC AATCAATTCG 1200
GTGGGTGGGA AACCACACTC CCACATCATG TTGGGGTCGG TCTCAAAAGG GGAGGGTTTT 1260
GGATCCTAAT TTAATGTCAG GAAATTAAAA AAAGAGACTT ACTGTGTTTA TCCCAGTATG 1320
ACTGTGGACA CATTATACCT ACACACAGTC CAAACAGCTT ACAAAAGATG ATTTTCATCA 1380
TAGGTGCCCT TTAAAGTAAA GTGTAGAGTG TGAATTGCTC CATCCGTACC TTCAGTAGCA 1440
GAAATGACAC ATTCCGAAAC TAGGGGTCAC TGTTGTGCTT CAATGGCACT TTTAATAAAA 1500
CAGACATTTT ATCTTCACAA CAGCAATGTC TGGACATAAA GAGGAAGAGA AAATTGGGTC 1560
AGGGCTCTCT GTGCTGGCAG GCTGGTTGTT CTTGTTTGAG AATGGAGTAT AGTTTTAAAA 1620
GCACACCTGG AAGGATTATC AGACACAGTG TAGGGAAGAC AAGGCAAGTG CTAGTGATTC 1680
TCTCACAAAT GAAGGATGAC 1700