EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09277 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:17830238-17832396 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr23:17830594-17830615AAAATTAAAAAGAAACTAAAA-6.09
IRF1MA0050.2chr23:17830260-17830281AGAAAGAAAGAGAAAGAGAAA-6.92
IRF1MA0050.2chr23:17830266-17830287AAAGAGAAAGAGAAAGAAAGA-7.75
RFX1MA0509.2chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT-7.42
RFX1MA0509.2chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT+7.44
RFX2MA0600.2chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT-7.66
RFX2MA0600.2chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT+7.76
RFX3MA0798.1chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT+7.35
RFX3MA0798.1chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT-7.75
RFX4MA0799.1chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT+7.49
RFX4MA0799.1chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT-7.69
RFX5MA0510.2chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT-7.77
RFX5MA0510.2chr23:17831746-17831762GGTTGCCATGGTAACT+7.79
Enhancer Sequence
AACTGCAATG GAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAGAAAGAG AAAGAAAGAG ACAGAGAAAG 60
AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG 120
AAAGAAAGAA AGGATGAATA CAGGTCAAAT ACAAAACAAT CATGTCATTG AGACAGTCTT 180
AAAATATGCC AAATCTTATT CATATTAATC ATATTAGCTC AGCAAACATT TAAAACAGTT 240
AGAAAGTAGT AAATATGTAA CCAAATCATC AATACAACTA AAAGATACAA AATGTAATTA 300
AAACTTCAAA TAAATATTAA AACAATAAAC ATGTATTTAC ATATTTTAAA AGTATTAAAA 360
TTAAAAAGAA ACTAAAAAGT AATGCAATTT GTAAAAGTAT TTAACGGTAG CTGCTTAAAC 420
AACACCACTC TAATATATCT CAATATTATT ATTGTTATTA TTATTATTAT TATTATTATT 480
ATTATTATTA TTATTATTAT TATTATAAGT AATAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTGGTAGT 540
AGTAGTAGTA ATAGTAGTAG TAGTAGTGGA AGTAGTAGTA GTAGTAGTAG TGGTGGTGGT 600
GGTAGTAGTG GTAGTGGTAG TAGTAGTAGT AGTAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT 660
AGTAGTAGTA GTAAAGGTAG TAGTAGTGGT AGTAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT 720
AGTAATGGTA GTAGTAGTGG TAGTAGTAGT AGTGGAAGTA GTAGTAGTAG TAGTGGTGGT 780
GGTGGTAGTA GTGGTAGTGG TAGTAGTAGT AGTAGTAGTA GTAGTAGTAA TGGTAGTAGT 840
AGTGGTAGTA GTAGTAGTGG TAGTAGTAGT AGTAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT 900
AATGGTAGTA GTAGTGGTAG TAGTAGTAGT GGAAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT 960
GGTGGTGGTA GTAGTGGTAG TGGTAGTAGT AGTAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTAATGGT 1020
AGTAGTAGTG GTAGTAGTAG TAGTGGTAGT AGTAGTAGTA GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT 1080
AGTAGTGGTG GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT GATTTAGGAT TTGTGACAAA GCTTTTAATA 1140
TATTGTTCAT ATAAATTTCT ATAATATCCC TGACTGATTA TATTATTGGA GTAGCATTAG 1200
AATACATGTA AATAAGATAC CCTGCTTCAT AAAGTAATAT AGAGAAGAAG AAAAAAAAAC 1260
ATCAATGAAG CATCCTGATC CTGCTATAAA TCCACCAGCC TATCTTTGAA GGCTGCTTAA 1320
AACAACCATA CACATAATGA GACTCTCCAG CTGGGAGGAC AGACCATTAG AATTTGACCC 1380
AAAAACAAAA TGACAAAATA TATGCGCTAA CATAAAATAA ATCCAAAGGA ATTTTCACAT 1440
CTCTCTCTCT CTCTCTCTGC CTGTGGAGAG CTCGGAGAGA TGGGCATGGT TGCTAGGTGA 1500
CCGGTTGTGG TTGCCATGGT AACTTTAAGT GGAACAGCTG GTCCAATCAG CATAAATTGC 1560
GGGCAAGCAA AGGCAGAGCC AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 1620
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 1680
AGAGAAATGA GGATGAGTGA AAGGGATAGA GAGGAAAAGA GTAGAAAAGG AGAGGTGGGA 1740
AAGAGGATGT GAGATAGAGA AAAGAAGCAG GAGACGAATC AAAAGCCAGC TTGGAGAAAC 1800
GGATAAGCGA GTAGAGAGCC AGAACAGGAC GGGAAAGAGG AGAGCAGCGT GAAATGCAGG 1860
AAATGATAGA GGAAGAATTC AAACTCTAGA CCTCCGTTTT AATACCAAAA AATATTCTTT 1920
TTTTATTGTT TGTATTAATT GACAAAAAAA TCAGTTTCAG GAAGTGCATG CCAGAGGGTG 1980
ATTTACTTCA AACATGCACT TCTTAAAGTA AAAGTTCAAC CAAAAAAAAC AGTCCCAATT 2040
TCATTACCAT CATGTTGTTA TAAACCTGTA GAACTAAGTG AAGTTTATGT ATAAACTAAT 2100
TTTGAGAGGA TCACGTGCTT ATGATTGCTA GCGGCTGGAT CCGCATTATC CAACGACT 2158