EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09257 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:16060969-16062275 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:16061774-16061791TGAATTAATTAATGAAA+6.02
ArxMA0874.1chr23:16061773-16061790ATGAATTAATTAATGAA+6.39
ArxMA0874.1chr23:16061283-16061300TAAATTAATTAACGAAT-6.69
ArxMA0874.1chr23:16061774-16061791TGAATTAATTAATGAAA-7.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr23:16061799-16061817GGAAGAAAGGAATGATGG+6.86
Lhx3MA0135.1chr23:16061284-16061297AAATTAATTAACG+6.41
POU6F1MA0628.1chr23:16061777-16061787ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:16061777-16061787ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr23:16061185-16061198AAATGAATGAATA-6.42
Enhancer Sequence
AGTTATGAAA CGCATCGCAA AAAATAAAAA ATTGTTGTTA ACTGATGTAG GGCCTGGGTG 60
GGCCAAGCTT CTGATTGGGT GGGCCAGGCC CACCCAGGCC CCCCCGTGGA GCCGGGCCTG 120
CATAGCACAC GTGCTGCTGA TGATGTGACA GTAAAAGTGA TTTGACTTGA TTTGATTTGG 180
ATTGACTGAA ATGACAGGAT GGGTGGATAA ATAAATAAAT GAATGAATAA ACTGCAGTCA 240
GGAAAGTAAC TATGGGTGGA TGGATGGACG AAGGGATGGA CTGAAATGAC AGGATAGAAG 300
GATGGATGGA TGAGTAAATT AATTAACGAA TTGCAGTCAG GAAAAAAGGG ATGACGGATG 360
GATGTACGGG CGAATGTATG GACTGAAATG GAAGGATGGA TGTATGAATA AATAAATGAA 420
TTTAATAATT ACAGTTAGGA AAGATGGATG AATGGATGGG TTGAAATGAC AGGATGGATT 480
AATAAATTAA TGAATTATTG AATTGCAGTC AGAAAAATAG GAATGATGGA CAGATGATGG 540
TGGGACAGAT GGAGGAACGG ATGGATAAAC GGACTTAATT AATGAATTAA TTAAGAAAGA 600
AAAGAATAAT AGACAGATGA TGGATGAATG GACTAAGATG ACAGGATAAA AAGACAGATG 660
AATGAATTAA TTGCAGTCAG GAAAAAAATG AAGGATAAAT GAATGGATGG ATGGTCTGAG 720
ATGACTAGAT AGAAAGATGG ATAAATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG 780
GTGGGTGGGT GGATAGATGA ATAAATGAAT TAATTAATGA AATTCTGTCA GGAAGAAAGG 840
AATGATGGAG AGATGATGGA TGAAAAATTC AAGGACTGAG AGAAATAATG TAATTATGAA 900
TAAATGGATG GATGAGTGGG GTGAAGAAAG GTTTAATAGA TGGAGAAAGA AAAAACAATG 960
CACCGAAGAA AGGATGACAG ATGGAAAAAG AAGTATTAAA AGAAAGAAGG AAAGAAAGTT 1020
GGATGGTTTA AAGTATTAAG ACAGACAGAT GATAAGATGA TAGGATAAAT GGTTAGCAGC 1080
GTCTCTTATA GTTCTCAGGA CATACTGAAA TGACATTAAA CGCTGCTCCT CTGATCTCCT 1140
CAGTGACTAT TAGGGACGAT CTGTATCCTC TTTATCTGCT GCCCGTAGGG AATCAGCAAC 1200
ATAATAAACA TCAGCGCCAC TCACAGAGAG ATGGGCAGGT CTGTGCAGTC AGGATTCTGA 1260
AAGCTCTGCT AACTGATTTG TTGTGGTGAA ATGTATTATC TGTTGT 1306