EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09241 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:14793728-14794807 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:14794144-14794161CCCATTAATTAATTAAT+6.68
Alx4MA0853.1chr23:14794144-14794161CCCATTAATTAATTAAT+7.12
Arid3bMA0601.1chr23:14794152-14794163TTAATTAATAT-6.62
ArxMA0874.1chr23:14794143-14794160ACCCATTAATTAATTAA+6.05
HAND2MA1492.1chr23:14794358-14794368AACACCTGCA+6.02
Lhx3MA0135.1chr23:14794149-14794162TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr23:14794146-14794159CATTAATTAATTA-6.46
POU6F1MA0628.1chr23:14794147-14794157ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:14794151-14794161ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:14794147-14794157ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:14794151-14794161ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AAAGACACAG CAATAGCATC AGATGTAGCA GATTGATTTT ATAACACCAG GTTAACATTT 60
CTGGCCCATT TACAGCACTT ATATATATAA AAAAATTAAA CGAATAATAG ACTTGGGTCT 120
ATTGGTGTGT GTGCACCATT GCTTTCAGGG TTTCTGTATT TATAACTATA GGTGTTGGAG 180
GTCGCAAGTC ACGTTGGGGG TCTCGGGTTG AAAAGAAATC CTTGATATAA ACTACATTAA 240
CAGAAACACC CTAACAACCA CCTAGAACAT CCCAGCAATA ACAGTAACTC TCAAAACAAC 300
TTAACAGATA AGCAGCAGTG CCACAGAAAC ATCCTAGAAA GTACACAGAA CACCCAAAGC 360
TACTTACCTA AACTACAGTA ACTGCATAAC TACACCCTTA CAACCACCCA GAATAACCCA 420
TTAATTAATT AATATTTACC TAACTTTCAG AAACTGCACA GCAACTCGCT AGCAATAACC 480
CAACTTAAAC CTCAGACAAA GTAAATGCAC AGCAACACCA CAGAAAGCAC CCAACATACC 540
CTAACACCCA TATAATAAAG CACTAGATAC CCTCAAAACA CCTTAGCAAA TGCTTGTCAG 600
TGCCCTAGCA ACCACATAAT AAAGTAACTC AACACCTGCA TCTTAAAACA TTCTAGCATC 660
ATCATGGCAT GCTCTGCAAC ACTTCAGTTT TCTTCAGAAA TGTGGCCTTG ATGAATAGCA 720
GAGCATGAAT TTTGCAAAAC CAAGGTCGTG TATTCAATTT CCCAGCGCCT GTAGTGGAGT 780
TGTCTGCCAT TTGCACGGAT GTAAATAGTG AGAGTTTGAG TACAGTTAGC AGTGCAGTTG 840
GATGTTTTAA CCACTAGAGT GTGCTGTTTC ATATAGAAAT ATTCAGACTC GCCCTGCTGA 900
AGCGACATCT AATGCATTGC CTGGACAGGA TGATGGTTTA CCGTGGTAAA TGATTCACAT 960
TTCTACATGT TGAATCTTAT TTGAATGTGC CAGTCATTTT TCTTATTTAT AAAACCAAAT 1020
CAATAATCAA GTAACTTTAC TTTGTAGCAT CAGTTGTTTT AGCAGATACT TGAGTGTAT 1079