EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09204 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:12433804-12435220 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr23:12434927-12434948GAACAGAAAAAGAAAGAAAAA-6.69
IRF1MA0050.2chr23:12434933-12434954AAAAAGAAAGAAAAAGCAAAA-7.09
Sox3MA0514.1chr23:12433972-12433982CCTTTGTTTT+6.02
TCF7L2MA0523.1chr23:12433947-12433961TCTCTTTGAAGTTT-6.05
Enhancer Sequence
TAATTGAACA AATCCTCGCT CTTATTAAAG CTCCTTTCAC TTGCTCCTGA AGTAATAACC 60
CAAGTTCTTT CATTTTATTC AAATGTTCAT TGTGTGCACT TCCATCATTA CTGTTGACAA 120
GAGTATTTTC CAGGGCTTGT AAATCTCTTT GAAGTTTTTG TATTGCTACC TTTGTTTTAG 180
AAGTAGAAAG TGAACTGTAA TTTTGACAAA ATATTCTAAT ATTTGCCTTA CCAACCTCCC 240
ACCACATATA CAAGTTTTCA AAAGAACCCT TTTTTAGCTT CCAATCATTC CAAAAATCCT 300
TAAACTTTTC ACAAAATAAA GAATCATTTA GCAATTTAGT ATTAAAATGC CAAAAATAAT 360
TTGGTTTTGA ACTTTTTTTC ATGGTTAAAC CAAATAATAT CAAATGATGG TCTGAAAATC 420
CAACAGGTAA AATAGAGACA TCAGTAATTT TATGATTCCA TTCTTTACCT ATATAAAACC 480
GATCTAACCT AGCTCCACTG ACCCTATTAT TAGACACTTT TAGCCAAGTA TACTGTTTAA 540
TTCCTGTATT CCTCCTCCTC CAAATATCTA TTAATTCAAA ACTTTTTAAA ATATTTGATA 600
AAACATCAGC TGATTCTTGG TGAGGTTCTT CTCCATTTCT ATCAATAGTA AAGTCAATAG 660
TGCAATTCCA GTCTCCTCCA ATAATAGTAC AAACCTTATA ATCAATTTTC TGAATGGCAT 720
TCTTTAACTT TAAAAATTGT TTGACACGCT CTGGCCCATT ATTAGGTGCA TAAACATTTA 780
TTAAATTAAA CACAAACCCT TCATATTCAA TCTTTAAGTG CAATATTCTT CCCTTCACAA 840
TCTCGTCTAC TACCAGAATT TTAATATTCA TATCTTTGGA AAAAATAATT GCTATGCCAG 900
CGCTTATATT TGTTCCATGA CTTAAAACAC TTTTCCCTTT CCACCAACCA GTCCACTCTA 960
ATTCATTATC TATAGTAGTA TGAGTTTCTT GTAAGAAGGC TACATTTATT TTATTAACTT 1020
TAAATAACTC TGATACCATT GCCAATTTAT TTCTATCTCT GCCCCCATTT ATATTTAAAG 1080
AGCCCACCCT CAACAGCTCC ATAGAAAAGA GTGAAAAGAT GGAGAACAGA AAAAGAAAGA 1140
AAAAGCAAAA AGTCCCATTT ACCTTGCATG CATTAAACAT TTGATCTCTT TTTCTTTTTG 1200
GAGACATTTG CCTTTTCCTT TCTCAACCTT GTTAACAATT TTCTCAACCT AAATCTTTTC 1260
TGTTTGCTTA AAGCATCATA ACTAACATTT TTTTGCCACA ATTTTACTGA GCGGATGAAT 1320
TTGTCAACAT CAGAAAAGAA ATCATTGATT TCAAAAACTT TACCAAAAGT TTCGTCCAGA 1380
AAATCATTTA TGTCCTGCAG TGTGTATACA TCATCC 1416