EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09161 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:6828037-6829221 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr23:6828624-6828639AACTAAACAAACAAA+6.14
Foxd3MA0041.1chr23:6828372-6828384AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828376-6828388AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828380-6828392AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828384-6828396AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828388-6828400AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828392-6828404AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828556-6828568AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828560-6828572AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828564-6828576AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828604-6828616AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828656-6828668AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828660-6828672AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828664-6828676AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828724-6828736AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828728-6828740AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:6828732-6828744AAACAAACAAAC-6.32
Enhancer Sequence
AACCCTAATG TTGGAAAAAG AAACTTCTAT AAATTTTCCA ACAGGTGAGA TCGCATTGTT 60
TTTACCCTAA TGTAGAATCG GTAGCTCCAG GATTACCCAC AAGTTTGAAG ATCCTCCCAT 120
ATGCTCTATT TGTAAAAGCA CTTCGACGAT GAAGCACATT CTATTGCATT GTGTTGGTTT 180
TAGTCCTGTG AGGAATTAGT TTTATTCAGT ACATTCATTT GAAGAGATTT TTAACAGTGT 240
TAATCCAAAT ACAGTTTTGG AGTTTTTAGC AAAAATCAAT TGTAAAACCT TAATGTAGTA 300
GTCTAAAGTG GTTACAGAAG CTGGCATGGC ATAACAAACA AACAAACAAA CAAACAAACA 360
AACAAACAAC TAAATGAACG AACGAACGAC CAACCAACCA ATCAAACAAA CAACCAACCA 420
ACCATCCAAC CAACCTTCCT ACCAGACAAA CAAACAACCA ACCAACCAAA CAAACAACCA 480
ACCAACCATC CAACCAACCT TCCTACCAAA CAAACAACCA AACAAACAAA CAAACAAACA 540
ACCAACCAAC CTACCAAACA AACATATAAA CAAACAAACA ACCAACCAAC TAAACAAACA 600
AATGAACAAA CAACCAACCA AACAAACAAA CAAACAAACA ACCAACCAAC CAACCAACCA 660
ACCAACCAAC CAAACAAACA ACCAACCAAA CAAACAAACA AACAAACACA CAAACAAACA 720
AAAGATGACA CCCAGTGATG AAGATGATTG TATTAATTAC TCACCCTCAT GTTATTCCGA 780
ACTTCAGAGT CCTTTGTTCA TTGCCCGAAC ACAAGTGGAG ATATTTTAGA TGAAATCTGA 840
CAGCTCCCTC ATTCTGTATG ACAGCAATGG CCCCAAAACA TTCAACAAAT CAGACACATC 900
AAAACATCCA TCAACATATT TTTAAAACAT CCTCAAAACA AACCATATGC CTCAGTGGTT 960
CAATTGGAAT ATTATCAAAC GACAAGAATT CATTTGTGCA CATTAAAACA ACAATAACAA 1020
CAACTGTATT CAACAGTTCT CTTCTCCTCA GTGTCAGTAT ATTGCGCACG TTCACAAGAA 1080
CACTGTTTGT GTCATTCTTG CTGTCCTGCT TATGTATACC TCAGATGCGC CTGTGCTTTT 1140
GCAAACAGAA AAAGTCATGT GCGGGCATCT GGGTGGGGAT ACGT 1184