EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09136 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:4070064-4071613 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr23:4070802-4070822CACCCACCCACCCACCCACC+7.33
RREB1MA0073.1chr23:4070990-4071010CACCCACCCACCCACCCACC+7.33
ZNF24MA1124.1chr23:4070926-4070939TATTCATTCATCC+6.33
Enhancer Sequence
AATACTGCAT TCCTTTTAAA CAGCCAAGGA AATGGACACA GATTAGTAAG CCAAGGGAGT 60
TTATTAACCA GCAATGGAAC TGAATTTTCT GTATGTCTGC ATGGGCAGGA CAATATATAG 120
TTTCAGCATC AATATTGCAA TGTGCACATA CGAAACAGTT ACATCGCAGG ATCTGTAATA 180
TCGAGTAGGG GTTACAATTG ACCAGATAAC GCAGTTCAAA ACATCGTGGA GTCTAAAGTT 240
TAATACAGTC AGATACTGTT AAATTTGATT GTGTTTATCT GACTTGTGAC TGTACGATTT 300
CAAGTAAATT TGTGTATAAG AAATCATATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 360
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 420
TCTATCTATC TATCTATCCA TCCATCCATC AATCCACTCA GCCATCCAGC CATCCAGCCA 480
TCCAGCCATC CACTCACCCA CCCGTCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA 540
TCCATCTATC TATCTATCTA TCTANNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 600
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 660
NNNNTCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCCA 720
TCCAGCCATC CATCCACTCA CCCACCCACC CACCCACCCA TCCAGCCAGC CAGCCAGCCA 780
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCTATCCA TCTATCCATC TATCTATCTA 840
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATTCATT CATCCATCCA TCCATCCATC CACTCACCCA 900
TCCAGCCATC CATCCATCCA TCCACTCACC CACCCACCCA CCCACCCATC CATCCAGCCA 960
GCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA 1020
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1080
TCTATCCATC CATCCATCCA TCCATCCACT CACCCACCCA CCCATCCAGC CAGCCAGCCA 1140
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCTATC TATCTATCTA TCATAGCTCT CCGAGTGTGA 1200
GTGGATGATT TTCTAATCTT CTTACGCCCG ATTCACACGT GGCTTTAGCG TCAACGCTTG 1260
ACCGAGGGCG TGTCTGAAGT TGGGTCAGCC AATGGAATTA GTCCACATTC GGCTGCTGTC 1320
TGAGCTAGGG TATTTGCATG AAGCAGTCTG ATAGGCTGAC GCTTCCGTTG GCGATTGAAA 1380
AGTTGAGAAT TTCCTAACTT CTGCAGCGAG CAACACCACT GAAGTGGAGC CGACGGATCT 1440
ACAATGCAGC TTGGCAACGC CTGACGTCAC CTATTCAAAG CGGATGGGAA GCATTGACGC 1500
TGATGCCCTG TGTGGATGGG CGTTAACGTT TCACTGTTTT GAAGCACGC 1549