EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09119 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:3139394-3140764 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr23:3140557-3140572GAGGTCAAAGGTCAC+6.04
HNF4GMA0484.1chr23:3140556-3140571AGAGGTCAAAGGTCA+7.22
NR2C2MA0504.1chr23:3140571-3140586CGGGGTCAGAGGTGA+6.86
NR2C2MA0504.1chr23:3140556-3140571AGAGGTCAAAGGTCA+8.25
NR2F1MA0017.2chr23:3140555-3140568CAGAGGTCAAAGG+6.74
NR2F1MA0017.2chr23:3140562-3140575CAAAGGTCACGGG+6.82
Nr2f6MA0677.1chr23:3140557-3140571GAGGTCAAAGGTCA+8.42
RXRBMA0855.1chr23:3140557-3140571GAGGTCAAAGGTCA+7.95
RXRGMA0856.1chr23:3140557-3140571GAGGTCAAAGGTCA+8.12
RarbMA0857.1chr23:3140563-3140579AAAGGTCACGGGGTCA+6.11
RxraMA0512.2chr23:3140557-3140571GAGGTCAAAGGTCA+8.12
Enhancer Sequence
ATATGCTCAA AAGTTTTATT TCTAGATAGC ACAAGACTCA TCGCTCTTTC CAGTGCTTTC 60
TATTGTGTAA CACTCATTAA GCGCAGTGTG TGTGTGTGCT GGCAGCGGTG GCCTTGGTTT 120
CACTGGATGG ACACAGGATG CGTAGGCTGG GACGTCCTGT GACCTCCTGC ACTCCTGTCA 180
TCAGTCTGGG CTTCTGCCTA CAGTCGGAGC AACCTATAGT GTGTGTGTGT GTAGTGTTTG 240
TGTATGCAAG AGTGTGTGTG TGTATAGTGT ACAATTTGTG TGTGAGGGAG GTGTATGTGT 300
GAAGGTGTGT ATTTTGGAGA GAGAGAGAGT GTGTGTGTGA GTGTGTGTGT TCCATGGGTT 360
TATTGTGTGA GTGTGTGTAG AGTGTCAGAG TATACAGAAT GTGTGTGTGT ATTGTGGGTG 420
TTCTGTATAG ATGGCGTGTC TGTGTGTGAC AGTGTTTGTA CAGTGTGTGT GTGTGTACAA 480
TGTGAGTGTA TACAGTGTGT GTGAGAGAGT CAGTATATCA TGGGGGGGGG TGTGCCTGTA 540
TGGTATGTAT GTGAGAGTGT GTGCATTGTG TGTGTGTGTG CGTGAACAGT GGTTATGTAA 600
GCGGGAGTGT GTGTGTACAA TTTGTGTGTG AGGGTGTGAA TTTTTCACAG ATAGAGTGTG 660
TGTGTGTTCC ATGGGTGTAT TGTGTGAGTG TATAGTGTGT TTGTGTGTGA GAGAGTGTGT 720
CTATCATGGG TGTGTGTGTG TGAAAGAGAG CGTATGTGTA CTGTGTGTTT GTGTGTGTAT 780
GAGAAAGAGA GTGTATAATG GGTGTGTGTT TTCATGTTTA TTTGTGTGTG TAAGTGCACG 840
TGTGTGTGCA ATGTGTGTAA GGGAGAGAAT GTGAAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGAGAG 900
AGAATTGTAT ATGCACCATG TGTTTGTGAC AGTGTTTGTA AAGTGTATAT AGACACAACG 960
GGAGTGTGTG TATATAATTT GTGTGTGTGA GAAGGAGAGA GAGTATGTTA AGTGTTTGTG 1020
AGAGTGTGTT TCCATGTTTA TTTGTGTGTA TAAGTGCATG TGTGTAAGTG AAAGTGTGTG 1080
TGTGCGTGCG CTAACAAATC CAGGATCCAC CTGTGATCTG GCCTTCTCAT CCTGTGCTCT 1140
GGAATAGTGC TCTATTAGGG CCAGAGGTCA AAGGTCACGG GGTCAGAGGT GAAGGAATAC 1200
TGAAACTTAT GGGAAGAGTT GACGGGCCGG TTTCAGCCAA TTGAGCCAAC AAGATCCAGC 1260
AGCTACCAGA TAATGACAGG AAGTTCCTGC GCTGTGATAT TATTAATGGC TCTTCACAGA 1320
AGTCGAGGAA CAACAGATCA TCCAGAGAAC GCTGAGTCCA AATGCAGAGT 1370