EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09101 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:2363561-2364595 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SOX21MA0866.1chr23:2363947-2363962AACAATGCAATTGAT-6.67
Sox11MA0869.1chr23:2363947-2363962AACAATGCAATTGAT-6.8
Sox1MA0870.1chr23:2363947-2363962AACAATGCAATTGAT-6.54
TCF3MA0522.2chr23:2364134-2364144AGCAGGTGTT-6.02
Enhancer Sequence
TGAAAAATTC AGCTTAAACC AGCCTAGGCT GGTTGGCTGG TTTTAGCTGG TTGACCAGCC 60
TGGTTTTAGA GGAGTTTTGG CCATTTCCAG GCTGGTTTCC AGCCATTTCC AGCCTGGTCT 120
TAGCTGGTCA GGATGGAAAA TGACCAGNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 180
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 300
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTGCTGTT GTGTAGTCCG TCCATTGTGT 360
TTCATGACTG CAGCAGATGT GTGCTAAACA ATGCAATTGA TAAATAAAAG GAAACTGTAT 420
AAATAGTCTA GTGCGTGCGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GCAGCTGGAA 480
AGTTAAAGCA TGTGGAGGCA TTCAAACCTT TAAAGCCTCG CAAATCCAAC CATATGTGCT 540
TTTTGTTTTT ATTCTATAAC TCTCTTCTCT TTCAGCAGGT GTTTGGCATG TGATATAACA 600
TAGATTAAGT GCAATTAAAC TGGGAATGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTACC TTGTATGCCT 660
TCCCACATAG CAAAATTTTG TGCATGTGCA AAAAAAATGT GCATGTGAAG TCCTATATGC 720
TAGCAGACAG GGTTGAACAT TTAAATACAG CTCAGATAAG AGCCCCAGAA ATAAATCTGT 780
CCCTATTAAA GTGCTGACAC ACACACACAC ACACACACAC AAAGAGAATA ATGCTATCAG 840
CCGCTGATAA CGTCAGCACC AAAAACACAG ATAAAACACA ATGCTGCAGT GCTTCTGAAT 900
GATGACCTCT TACAGCATGC AGGAAATGAT TATCAGACAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 960
AGAGAGATGA AAAATGGAGC ACAACAGCAG GGTCTCAGAT GTAAACACAC CGCTCATCTT 1020
CATGATTGTA GGCT 1034