EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09095 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:2173864-2175009 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr23:2173975-2173990TGACCTCTGACCTCC-8.03
Nr2f6MA0677.1chr23:2173975-2173989TGACCTCTGACCTC-7.42
PKNOX1MA0782.1chr23:2173959-2173971AGACACCTGTCA-6.44
PKNOX2MA0783.1chr23:2173959-2173971AGACACCTGTCA-6.07
RREB1MA0073.1chr23:2174639-2174659TGTGTGTGTGTGTTTTGTGT-6.71
RREB1MA0073.1chr23:2174702-2174722TGTGTGTGTGTGTTTTGTGT-6.71
RXRBMA0855.1chr23:2173975-2173989TGACCTCTGACCTC-6.84
RXRGMA0856.1chr23:2173975-2173989TGACCTCTGACCTC-6.91
RxraMA0512.2chr23:2173975-2173989TGACCTCTGACCTC-6.88
Enhancer Sequence
GAGCTCCGAC CTCCAACGTC TCAGAGGCAG AGAGACGAGC TGGTTTACTT TCCTCTGATT 60
TGATTTACCT GCCTCCACTG CACCTGCTGG ACTACAGACA CCTGTCAGCG CTGACCTCTG 120
ACCTCCAGCT GGAGCCCTGA GGTCACAGGC AGAGGTGTAA TTAACACACA CACTCACACA 180
CAGAGAGGGA GACACTCACA CATACACACG CACATAAACA CACACACACA AACACACGCA 240
CATGTGTACA AACACAAACA GTGTGAGTGA GTGTACTTGC ATAGGTGTGA GAAAGTGTAT 300
GTGCCTGTGT GTGTGTGTGT GTTTTCAATT GTGTCTATAT GCATGTGTGT GTCTGCTTGT 360
ATGTGTGTGT TTTTAACTGT GCACATGACT GTGTGTGTTT GTGGGAGAGA GTGTGTACGT 420
TTGTGCGATA GAAAGAGAGT TTATGTGTGT GTGTATTGGA GAGAAAGATT GTACATATGT 480
TTTGTGAGCT TGTGTGAGAG AGAGATTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTTG TGTGTGTTCC 540
TCTGTGTTTG TGTATGCGAG TGTGTGAGGG GTGAATGTTT GCTCTTGTTA TCATCCTGAC 600
ATCAATCTGT TGAGGATTAA GACTAACACA CACGTGTGTT TACAACACAA GATGGAGATT 660
TGCTCTGTTT GCCTTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGG GTGAGTGAGT 720
TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTGT GTGTGTGTGT TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 780
GTGTGTGTTT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 840
TGTGTGTGTG TTTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TCATCAAGGT TTCTTCATTA 900
ATACTGTGTT TGCCTGAACA TCAGTATTGC ACACACTTGA GATTAGCGAA TCAAAATCCA 960
ACGGTTGCAT AACTCACGCT TCATCATTAG TGGTACAGCC GTGAATCATG CTGTGTCGAG 1020
GAGGAGTGTG TTGTTGTGTG TATCTGTGAC GCATCTTGTG TTTAGACCCA GATAGCATAC 1080
GAATGTGGGC CACTTTAGGC AGTTATGCGG CACTGGTGGT CTTCCTTCGG CCCAGACTAA 1140
ATGAA 1145