EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09092 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:2072785-2073769 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA5MA0766.2chr23:2073193-2073203TCCTTATCTG-6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr23:2073422-2073439TGTCCTCTTAATGACCT-6.13
Sox6MA0515.1chr23:2073543-2073553CCATTGTTTT+6.02
TCF4MA0830.1chr23:2073005-2073015AGCAGGTGCG-6.02
Enhancer Sequence
GGGGTAGGTG TAGACATTCA TAAAGCACAA TGTTGGACTC TAGGTTTGTA CAGCCCATTT 60
GGAGCTCAAG GCCCACCCAC TTGGAGCTGG CTCTGACCTC TGTTTATACC ATAGGTCTCA 120
AACTCCATTC CTGGAGGGCC ACAGCTCTGC ACAGTTTTGC TCCAACCCAA ACACAGCCGA 180
TTCAACTAAT CAAGGTGTTC AAGACTAGTA GAGACTATTA AGCAGGTGCG AGCTAGAGGT 240
GGTTGGAGCT AAACTATGCA GAGTTGCAGC CCTCCAGGAA TTGAGTTTGA GACCACTGGT 300
TTATACCCTT CTCAAGTCCA GCAGAGATTA GCTTGCCTTC ACTACTGGTT GATTTGTGTT 360
TTATTAGAGT TGGACCTGAA CTCTGCGGGA CAGTGGGTTT CCAGAAACTC CTTATCTGAT 420
CTGAGGTCAG GAAGAGCTGA CCTTGCACTG AATCTGCCTC CATTAGACTA CACTCCAGGA 480
TGAATTTGGC TTTGCTGGGT CCACATGATA TCCTCTTTCT ATTGATTTGG TGCCATTGAT 540
TGGAGCTGAA GGCAAATCCC AATCCCCACT GATATAATCA GGCTAATGAT GGCAGATTAG 600
AGTGATACTC CGCTGTCATT AACAGCAAAC GAGTGCTTGT CCTCTTAATG ACCTCTCCAG 660
GAATCCCTCC CCTCCTGCTG CCTTTATTCC TGCTTTCCTT GACCTCTTTA TACGCCAGAC 720
TCATGTAGTA CTCTCTCTTT CTCCTCCTCG GCTTTCATCC ATTGTTTTTC CTCTTTTACG 780
TTCCTTCCTC TTGCCTTTCT TTTAAAGTTG CACGTTCTCA CTCCCCCGTC CTCTATACTT 840
GAGCTTTTCA CTTTGCCCAA TCACGAAATC TACTTAACTG CATTTGCACA CAAAAGCTCT 900
GCTTTTATCA TGCGTTACAT TTCCTCTTCT GTGTTTCTAA CAAGAGTCCA GCTTTCTGTG 960
GTGCACTGAT TGTGTAACTC CCTC 984