EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09084 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:1302048-1303988 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT+6.75
RFX1MA0509.2chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT-6.75
RFX2MA0600.2chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT+6.56
RFX2MA0600.2chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT-6.69
RFX3MA0798.1chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT+6.02
RFX3MA0798.1chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT-6.36
RFX4MA0799.1chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT+6.41
RFX4MA0799.1chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT-6.76
RFX5MA0510.2chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT+6.2
RFX5MA0510.2chr23:1302939-1302955AGTTGTCATGGCAACT-6.42
ZSCAN4MA1155.1chr23:1303617-1303632TTGTCAGTGTGTGCG-7.38
Enhancer Sequence
CTCATCTCTT CACATCACAG ACACACAGAC ACACAGACAC ACACACACAC ACACACACAC 60
ACACACACAC ACACACACAC ACACACTGAT ATCACATGTG CACACACACA CCTTCATATC 120
ACACACATCA CACAGATACA CACTCTGACA TAACACACAC ACCCGCTCAC CTTGACATCA 180
AACACACAAT CACCTCACCT CACACAACCA TCACGTCACA CACATTTACG TCGCACACAC 240
ACACAGACAC AGACATACAT ATCTTTAGAT CACACACACA AAGATTCAGA TTGCACACAC 300
AAACATACAC ACCACTTCAC GTCATGCGCA AACACACTCA CTCACCTTGA CATCAAACAC 360
ACACAAACAC ACAACCATAA ACTCACTTCA CAAAACCTTT ACATCACACA CACACACAAA 420
CACACGCACA CAATCACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 480
CACACACACG CGCGCACACA CACACACACG CGCGCACACA CACACACACA CACCTTTACA 540
TCTCTCACAC ACATACTTGG ACACACACTT GCGTACAAAC ACACACACAC ACACACACAC 600
ACACAAACAC ACACACACAC ACACACATCT TTAGATCACA CACACACAAA AAAATCACAT 660
TGCACATACA CACACATGCA ATCATATCAC ACATACACAC ATACACGCAC CTTTACATCT 720
TTCACACACA CACTTGGACA AAGACTTGTG CACACACACA CACAGACACA CACACATACA 780
CACACCTACA CATCTTTAGA TTGCACACAA ACATTCACAT CACACACACG CACACACAAA 840
CATTGATGTC ACACACACAC ACATCACACT TTGAGCTTCT GTTTACAGTG GAGTTGTCAT 900
GGCAACTGTT TTGTTTGACA GCACCATGGC GGCCGCTGCA CTTTAGCGCT GCGTCTCTCG 960
TTTTGGAGCA TAAAGACGGT GTGTGTTCAG TGTGTGTTCA GTGTGTGTGA GCTCTTAGGT 1020
CATCAGTGTG TTCACAGCAG CTCAGTAAAC AGATGATGAT GATCAGTGAG GCTGGTAATA 1080
TACAGACAGA CAGTCCTTCA GCGCTCATCT CTCCAGCGTT CAACTTCTCT GTTAATGTCC 1140
TGTTTTACCC TCCGTCACTC CGAAAGTCTC TCGTTGTGTC TCGCTGTCCT CTCCGAGTGT 1200
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTAG CCAGAAGCCT TCAGCTCTCA GACAGACACT 1260
TTATCAGACA CTGAGAGAGA CCTTGTGGAC ATCTGACAGC ACCTTCCGTG TGTGTGTGTG 1320
TCTGTATGTG TGTGTCTCTG TCTGTGTTTG TCTATATGTG TGTTTGTGTG TGTGTCTGTA 1380
GGTGCGCGTT TGTATATGTG TGTCTTTGTG CATTCATGTG TATATATGTG TGTGCATGTA 1440
TCTGTGTATG TGTATGTATG TGTGTGTTTG CATGCATGAG TGTTATTGTG TGTGTGTGTC 1500
TGTGTGTGTG TGTGTTTGCA TGAGTGTGGT TGTATGCTGG TTTAGTTGTG TGTGTTTGTC 1560
TATGAGTGTT TGTCAGTGTG TGCGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATA TGTTCGCATG 1620
TGCTTGCGTG CGTGTGTGAG TTTGCATCGG TGTGTGTGTG TGTCATCTGA TCTGTTCAGT 1680
ATAGGCACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGAGGTGT GTTTGTATGT GTGTATGTGT 1740
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTCCATCTAG AGTCAAAACA CACACACACA CACACACACA 1800
CACACAGTCC TCCATTAGAC AGTAATGTAG TAAAGGTGCT TTATGTAGCT GATCTGCTTT 1860
TCCATCTGAA TGCATTAAGA GTCTGTGGCT CTGTCTGAGA GCAGGAGTAC AGAGCTAGGG 1920
AGTCAATATA GCAACATATA 1940