EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09083 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr23:1300384-1301738 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr23:1300619-1300629GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr23:1300619-1300629GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr23:1300619-1300629GCTAATTAGT-6.02
PBX1MA0070.1chr23:1300907-1300919ATTGATTGATGT-6.44
RFX3MA0798.1chr23:1300485-1300501AATTACCATGGTAACC+6.16
RFX4MA0799.1chr23:1300485-1300501AATTACCATGGTAACC+6.18
RFX5MA0510.2chr23:1300485-1300501AATTACCATGGTAACC-6.08
RFX5MA0510.2chr23:1300485-1300501AATTACCATGGTAACC+6.15
TFAP4MA0691.1chr23:1300388-1300398AACAGCTGAT+6.02
Enhancer Sequence
GTTGAACAGC TGATCTACAT TTCTGCTTGA GCTGATATGC CACAATCTGT TGTATTTGAA 60
TGTTCCAGCC TGATGATGCA ATGGTGACAT CATAATCACT TAATTACCAT GGTAACCAGC 120
AGCTCAGTCT GACCTGCTAA AGGCATGTCG ATGTGTGGAT TATGGGATAT GATGTGACGG 180
CGATTCTTGC GTAACCGCAG CTCATTAAAA TCTCATAGCG CAGACACTCA TGTGTGCTAA 240
TTAGTTCACT CGGAATATAA CACTGATGCG AGCGCAGACT TATTAAAATG TGTTTGATCA 300
GATCAGGTCA AGCTAAGGAG AGTTTAATAA CTGTCCTCTT GGTTACGCTT AATGATGTTA 360
TGGAGGCGGA CGTGTGCTAT TTTAGTAAAA CGAGTTATAT CATTTATTAC TTTCCACCCT 420
ACGATATGCT TGATTATTAT ATTCCCTTCA CAAATGAACT GAAGGATTTA CACATGCACT 480
GTTGAAATAA AGTGTAGATA TTTTTGTGAT ATGATCAACA TTTATTGATT GATGTGATTC 540
ACTTAAATGT CAATCAGTCA ATCCAATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC 600
TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC ATCTATCTAT CTATCTATCT 660
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 720
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCA TCTATCCATC CATCCATCCA 780
TCCATCCATC CAACCAACCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA 840
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA 900
TCATTTCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 960
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 1020
ATCTATCTAT CTATCTATCC ATCCATCTAT CCATCCAACC ATCCATCCAT TCAGCAAGTC 1080
TTCTTAATAG TGAACATGAT TACACATCAG ATTTTTTACT CAAGGACTTT TTTTTATTTT 1140
GATGATACAG ACAGGAGCCA TTCAGCGTCA CAGTGCTGAG ACTCTCAGAG CAAAACACAC 1200
TACAAACATC AGTTCATCCC CTCACAAAAC ACACACTCCA TCTGCTGATT CACACACACA 1260
AACACTCCAT CAGCTGAAGG TGTCTCAGAG GACGTCTTAC TGTGTCTTTA CATGGCAGAA 1320
GAAACAAACA TTGAGCAGAA AACGACACTC TAAT 1354