EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09054 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr22:39210892-39212022 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr22:39211716-39211727GTTTTATTGCC+6.32
CDX4MA1473.1chr22:39211716-39211727GTTTTATTGCC+6.62
HOXD9MA0913.2chr22:39211716-39211726GTTTTATTGC+6.02
Enhancer Sequence
CTTCTCTATA TGATGTCAGT GTTATATTGA ATGTAGTTAA TTTATTTATG ATTATTTATG 60
ATTAATGTAG CCTTGTGTAC AGCGACTCAG CATGTTCAAG CACAATGACT GGCAGGATTA 120
AAATCACTCC AGATGTAATG AATGTAGAGC TGATGATCTG CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 180
GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT GTACGTGCAG TGGTCAGAAT GTCGATAAAA TGACTCAGAC 240
TCAACTTTAT TTTTCCGTTG AGGGAAACAA CAATCTGTCA TGGGTCTTGG GCTTTTCCAG 300
GTGATTAAAC AGGTAATTTA ACAGTGGAAT ATTAGCATCT TCAACTCCCC TGCTCTGTCT 360
AAATGCAAAC AGCAAAGGAT CAAATTTATC CTTTGAATAC AATAAAATCT CACCTTTAAT 420
AATTCTCTCG AAATACTTCA TAACTAATGA AGTAAGGGCA ACAGGTCTAA AATCATTTAA 480
CTCCCGCAGA AACTTATTTT TGGCTATAAG AACAGATTTC TTCCAGATTT CAGGAACCCT 540
TTGCAATGTA AGAGACTGAA GAAATGCAAT GAAATATTTC AGAAAGTTGT TCAGCACATG 600
TATGTAGCAC CCTACCACCA ATATTATCTG GGCCCGGGCT TTTTTTAGTA TAAATTCTCT 660
GAAAGAGGTC TTTTACCCGA GTCTTACTAA TGTTTACGGA TTTACTACAT GACAGGTGTT 720
TTAAAATGTC ATTTTCTGAC TTAAAATCAC CCTCATCAAA CCTCAAGTAA AACGTATTTG 780
ATTCCTCAGC AAACTCTCTC ACTGAACTAT AACCATTTAA ATTGGTTTTA TTGCCCCCTC 840
TATCTTCTTT ACTCCCAACC ATTGTGTTCA CTCCTTGCCA GGCTGATCTT AAGTTTTCGT 900
TGCCAAATTG CTTCTGTTTC TCTATTTGTT ATGTGTGTTG TTTTTTCACT TTTGATTCAT 960
GTTAAACAAA TCACACATCT GAAAAAAGTG TGAGTATTAT TAATATCATC TCCATTAAAC 1020
TGCATGAATC AGTTTGCCTG ATAGGAGACA TTAATCTGTG TATACAGATT GTGAATTACC 1080
ACACTAAATC AGCTGTACTC CTCATAAATG GTAACCCCAC AGAAATATTT 1130