EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-09019 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr22:37239680-37241413 
TF binding sites/motifs
Number: 38             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr22:37239911-37239922TTTTATTGCTT+6.32
CDX2MA0465.1chr22:37239987-37239998TTTTATTGCTT+6.32
CDX2MA0465.1chr22:37240027-37240038TTTTATTGCTT+6.32
CDX2MA0465.1chr22:37240165-37240176TTTTATTGCTT+6.32
FOXC2MA0846.1chr22:37240370-37240382TTTGTTTATTTA+6.18
FOXE1MA1487.1chr22:37240825-37240840TTTGTTTGTTTAATT+6.26
Foxd3MA0041.1chr22:37239878-37239890GATTGTTTGTTC-6.02
Foxd3MA0041.1chr22:37240010-37240022GATTATTTGTTT-6.07
Foxd3MA0041.1chr22:37240721-37240733GATTATTTGTTT-6.07
Foxd3MA0041.1chr22:37240085-37240097AATTGTTTGTTT-6.22
Foxd3MA0041.1chr22:37240329-37240341AATTGTTTGTTT-6.22
Foxd3MA0041.1chr22:37240046-37240058GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr22:37240117-37240129GTTTGTTTGTTT-6.32
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Foxd3MA0041.1chr22:37240852-37240864GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr22:37240856-37240868GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr22:37240860-37240872GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr22:37239898-37239910GATTGTTTATTT-6.62
Foxd3MA0041.1chr22:37240277-37240289GATTGTTTGTTT-6.92
Foxd3MA0041.1chr22:37240365-37240377GATTGTTTGTTT-6.92
Foxd3MA0041.1chr22:37240589-37240601GATTGTTTGTTT-6.92
Foxj3MA0851.1chr22:37240367-37240384TTGTTTGTTTATTTATT+6.03
Foxj3MA0851.1chr22:37239860-37239877GTGTTTGTTTATTTGTT+6.55
HOXD9MA0913.2chr22:37239910-37239920GTTTTATTGC+6.02
HOXD9MA0913.2chr22:37239986-37239996GTTTTATTGC+6.02
HOXD9MA0913.2chr22:37240026-37240036GTTTTATTGC+6.02
HOXD9MA0913.2chr22:37240164-37240174GTTTTATTGC+6.02
Hmx2MA0897.1chr22:37240023-37240040ATTGTTTTATTGCTTGT+6.26
Hmx2MA0897.1chr22:37240161-37240178ATTGTTTTATTGCTTGT+6.26
Hmx2MA0897.1chr22:37240651-37240668ATTTTTTAATTGTTTGT+7.99
Hmx3MA0898.1chr22:37240023-37240040ATTGTTTTATTGCTTGT+6.13
Hmx3MA0898.1chr22:37240161-37240178ATTGTTTTATTGCTTGT+6.13
Hmx3MA0898.1chr22:37240651-37240668ATTTTTTAATTGTTTGT+8.07
PBX1MA0070.1chr22:37240094-37240106TTTGATTGATTG+6.18
Enhancer Sequence
TTCAGCATTT AGAGAGCATT TAGAAATAGC TACATAATTC ACAAACATGT TGACAAAAAC 60
AGATGTTTGT ATAACCAACA TAAACGGTTT GCAAATATTT AAACCAGAAC ATTTTGGAAT 120
ATTCCAAGAA CATTTATAAA TATATTTTTT AAAACGATCT TAGAACTGTT TGTTTGCTTG 180
GTGTTTGTTT ATTTGTTTGA TTGTTTGTTC ATTTGTTTGA TTGTTTATTT GTTTTATTGC 240
TTGTTCATTT GTTTGATTGT TCGTTTGGTT GATTGTTTGA TCATTTGTTT AATTATTTGT 300
TTATTTGTTT TATTGCTTGT TCATTTGTTT GATTATTTGT TTGATTGTTT TATTGCTTGT 360
TCATTTGTTT GTTTGTTTGG TTTTTGGTCG ATTGATTGAT TATAAAATTG TTTGTTTGAT 420
TGATTGTTTG AACATTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT GATTGAATGT TCATTTGTTT 480
GATTGTTTTA TTGCTTGTTC ATTTGTTTGT TTTGTTCATT CATTTGTTTG ATTGTTTGCT 540
TGATTGATTG GTTGACTGTT CGATCATTTG CTCTTTTGTT TAATGGTCTG ATTGTTAGAT 600
TGTTTGTTTG ATTGTCTGCT AGTTTGTTAG CTCAATGGTT TATTTATTCA ATTGTTTGTT 660
TGTTTATTTG GTTGATAGTC TGCTTGATTG TTTGTTTATT TATTTATTTT TTTTTTGGTT 720
GATTGTTTTA TTGTTTGTTT GATCATTTGT CCGATTGTTT GGTTCGTTGA CTGTTTGTAT 780
GGTTGATTGT TCATTTGTTT GTTTGGTAGT TTATTAGATT TTTTTATTGA TTGATTGATT 840
GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGT TCGTTCATTT GTTTGATAGG TTGATTTGTT 900
CATTCCTTTG ATTGTTTGTT TTTTTTGGTT GACTGTTTGA TTGTTTGATA GGTTGTTTGT 960
TTGTTTGGTT TATTTTTTAA TTGTTTGTCT GTTTTTCTTT CATTTGTTTG CTTGTTTAAT 1020
AGGTTTATTG TTCATTTCTT TGATTATTTG TTTGTTTGGT TTATTGTTTG ATTGTTTGAT 1080
AGGTTGATTA TTTCTTTGAT TCTTTGCTTG TTTGGTTTAT TGTTTGTTTG TTTGTCTGTT 1140
TTTTATTTGT TTGTTTAATT GTTTGATATG TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT TTTTCATTCG 1200
TTTGTTTGAT TGTTTGATAG GTTGTTTGCT TGTTTGTTTG GTTTATTGTT TGACTGTTTG 1260
TCTGTTTGTT TTTCATTCGT TTCATTCTGT TTCGTTGTTT GTTAGTTTGG AGAAGAATCC 1320
TTTTCTTGTC AAATATACTC CAAAAACTTT TATGTGCAAC TTTGTAAACT CCTGCTTTAC 1380
AGTATACAGG ACGGCCATGG CCTCATTGTG GCGAATCTTG CGTAACTGCT GTTTGCTGTT 1440
GATTCGGAGC CGTTCATTTG GCTGGGGCCT CAATCTGCCC CTAAATGAAG ATGACAGGAA 1500
CCCCACTGTG GGTTCTAGAT GGAGCTGTAA CCTCACAGAC GGGGCAACAT CATTAGGGGG 1560
CCGCAAAACC TAAAACGACT AGCATTTCTC CTGCCATCAA CAATGCTTAT CCAGCCAGTA 1620
ATGAGGCACT TCATTTGCGG TGCGGCTGAT TCCTGATCAG TTGCTGAAAC CGGAGCCGGT 1680
GGTCGTGAGG TCTATAACCA AAGCGACGGC GCCGAGGTGT GTGTGACAGG AGC 1733