EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08987 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr22:35314840-35316200 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr22:35316037-35316054TGTGTTAATTAATTAAT+6.05
Alx1MA0854.1chr22:35316044-35316061ATTAATTAATTAATTGT-6.08
ArxMA0874.1chr22:35316040-35316057GTTAATTAATTAATTAA+6.1
ArxMA0874.1chr22:35316044-35316061ATTAATTAATTAATTGT+6.28
Hmx2MA0897.1chr22:35316048-35316065ATTAATTAATTGTTTTT-6.8
Hmx3MA0898.1chr22:35316048-35316065ATTAATTAATTGTTTTT-6.62
Lhx3MA0135.1chr22:35316039-35316052TGTTAATTAATTA-6.12
Lhx3MA0135.1chr22:35316042-35316055TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr22:35316046-35316059TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr22:35316043-35316056AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr22:35316044-35316054ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr22:35316048-35316058ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr22:35316044-35316054ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr22:35316048-35316058ATTAATTAAT-6.02
SOX21MA0866.1chr22:35314987-35315002AAAAATGGTATTGTT+6.3
Sox1MA0870.1chr22:35314987-35315002AAAAATGGTATTGTT-6.12
Enhancer Sequence
ACCAACAGAC GATAACTGTA ATAATAACTA TATTAGCATC CGCAACAACA GACAATAAAT 60
ATAACAATAC CTATTAAATA TAATGATAAC AATATTAGCT AGGGGTTTTA TACAGAATTT 120
TAGCGTCAAA GAGTTATGCA GAAGCAGAAA AATGGTATTG TTTATCGTTT TAGTTATTGT 180
CTGTTGTTGC GCATGCTAAT ATAGTTATTG TTATAGTTAT CATCTGTCTG TGTAAATGCT 240
AATATAGTTC TCTTCTGTTG TTGTAGATGC TAATATAGCT ACCATTATAG TTATCATTTG 300
TTGTTGTGGA TGCTAATACA GTTATCGTTA TAGCTACTGT CTGTTGGTGT GGACGCTAAT 360
GTAGTTATCG TTATAGCTGC TGTCTGTTGG TGTGGATGCT AATGTAGTTA TCGTTATAGC 420
TACTGTCTGT TGGTGTGGAT GCTAATGTAG TTATAGTTAT AGCTGCTGTC TGTTGGTGTG 480
GATGCTAATG TAGTTATAGT TATAGCTGCT GTCTGTTGGT GTGGATGCTA ATGTAGTTAT 540
CGTTATAGCT GCTGTCTGTT GGTGTGGATG CTAATGTAGT TATCGTTATA GCTACTGTCT 600
GTTGGTGTGG ATGCTAATGT AGTTATAGTT ATAGCTACTG TCTGTTGGTG TGGATGCTAA 660
TATAGTTATC GTTATAGCTA CTGTCTGTTG GTGTGGATGC TAATATAGTT ATAGTTATAG 720
CTACTGTCTG TTGGTGTGGA TGCTAATATA GTTATCGTTA TAGCTACTGT CTGTTGGTGT 780
GGATGCTAAT GTAGTTATAC TTATAGCTAC TGTCTGTTGG TGTGGATGCT AATATATTTA 840
TCGTTATAGC TACTGTCTGT CGGTGTGGAT GCTAATATAG TTATCGTTGT AGCTTTCAGT 900
TGTTATCTGT TTATGTGGTT GTTAATATAA TTGTTGCTAT AGCTATTGTC AGTTGATGCG 960
TCAGCATAGC ATGACATAAA TACTATTTAG TAACAAAATT TGGTTTTGCA AATAAAGAGA 1020
GCAGCGGTCA AATACGCTAC AATTATTAAT TTACAAATAC ATTTGTTATT ATTAGTGACT 1080
CACTTGAACC TAAACTCACT TCATACCAAA AACATAACTA TTTTAAATGG TCATTAGCTT 1140
TGTTATACTT CCAAAATGGC TTCCCAAGTG TCGTAATACA TTAATAAAAC AGCCAGTTGT 1200
GTTAATTAAT TAATTAATTG TTTTTTTAAC GGATGATCTC CAGGCCTTGC TGTTAGCAGT 1260
CGAATCTTCT GTCATCTTTG GTCTTACTGT GGATCATTTC CTCTTCTTCA ACTCTCTACT 1320
TCTGTTTTTC TTCTCTGTGT GTGTGAAGGA GGGGGTCACA 1360