EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08649 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr22:3858901-3860360 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr22:3859134-3859155AAAGAGAAAGTGAAAAACAGG-6.14
IRF1MA0050.2chr22:3859128-3859149TTAAGAAAAGAGAAAGTGAAA-6.18
ZNF143MA0088.2chr22:3860291-3860307CGGTGGATTATGGGAG-6.5
Enhancer Sequence
TGTTGGGCTC CGCTGGCTGT AATTATGAGG GTTCGCGATC ACATCAAACG GGCCGCCGCG 60
GCGACGGGGT CATCAATGGT CACGCAGAAA CCCGCTGTCG ACGCGCCGGG GCTCCGTCTC 120
ATCTGAAGAC TTCAAAACAA CATCAGCGGC TTCAAAGATG GAGATCCAGA TGCGGAGCAC 180
GTCTCTGAGC AATGGCAAAA AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGATTA AGAAAAGAGA 240
AAGTGAAAAA CAGGATGGAT GGATGGAGGG ATGGATATAC CGACTGTTGA CTGGAAAGAT 300
TAATGGATAG ATGGATGGAT GGAACAGTTG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 360
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 420
AGATAGATAG ATGAAGGGAT GGATGGATAG ATGAATGGAT CGACCATTAG ATATATAGAC 480
AGATAGATGG ATGGATAAAT AGACCAACAG TTGACTGGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 540
AGATAGATAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ATAGATAGAT 600
AGATAGATGG ATGGATGGAT GCATGGATGG ATGGATGGAT GGATGATGGG ATGGATGGAT 660
AGACCGACTG TTGACTGTAT AGATGGATGG ATGGAACAGT TGATAGATAG ATAGATAGAT 720
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATGAAGGGAT 780
GGATGGATAG ATGAATGGAT CGACCATTGG ATATATAGAC AGATAGATGG ATGGATGAAT 840
AGACCAACAG TTGACTGGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATGGATGG ATGGATGGAT 900
GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATAGACCGAC TGTTGACTGT ATAGATGGAT 960
GGATGGAACA GTTGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 1020
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATCTAA TCAAATAGAA CGACTCACGG 1080
ACTGGATAAT GACTCTTATG AATCCTTTCG TGTCCTCGAC TCTTTAGGCA CAGCCGTTTC 1140
ATAAGCTGTT TGGCCTCGTC TTTATTTCTG CATCTTGTTC TTTGGCAGAT CTGAATCTGC 1200
AAGTCATCCG AGCTCAATGT ACCGCACACA CCGAGCTAAT GAAGATCCTC AGCAGGTAAT 1260
GAGCGCAGGT GTCATGTCAC ATTTCTTCAC TTCGGCCCCT ACAGAGGCAG CTGAGGCTAG 1320
AAATATCCCT GTAAGAGCAC TCAGAACTTC ACGAACTGAG TTTGTGCGTG ACTGCCTGTG 1380
TGTAACCGCG CGGTGGATTA TGGGAGCCGC AGCGGCGCCA AACAAATCCT GACAGACGGC 1440
TCATTTCAGC TGCGCACAA 1459