EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08629 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr22:961663-962595 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr22:961826-961840CGGCAGGGGGCGCC+6.99
RFX1MA0509.2chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA+6.83
RFX1MA0509.2chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA-6.83
RFX2MA0600.2chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA-7.04
RFX2MA0600.2chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA+7.09
RFX3MA0798.1chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA+6.99
RFX3MA0798.1chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA-7
RFX4MA0799.1chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA-6.32
RFX4MA0799.1chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA+6.75
RFX5MA0510.2chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA+7.37
RFX5MA0510.2chr22:962567-962583TGTTGCTATGGTAACA-7.3
Enhancer Sequence
ACATAGAGGT AAAGTTGGTT TTATATTCGC ACATTCAGAC TTTCCCCTTA ATAATAGAAT 60
TTCATAAAAG TATTATTTGC AAACTCTAAA TAGCGAAATC ATATTAGCAG CAAATGAATA 120
TCAAAGCACA ACACTGCTCA CAGTCAAATA ACAGTGTTAA TGTCGGCAGG GGGCGCCAGA 180
TCTGCACAGA ACCTGCTGTA AGTGGACAAG CAGGGGGCGC CAGACCCTCC CTTCAGGATG 240
TGTTTGGAGG CTGAGAGAAA CTTCCACTGC AGACAGAAAG TGTTGAGGTG AGAGTGTGTG 300
TGTGTGTGTG TGTGATGGCG CTCAGAGCTG CGCTGCTGAA GAGCATCTGG TACGCCTTCA 360
CTTCTCTGGA CACCGAAGAC AGCGGAAAAG TGTCCAAATC ACAACTCAAG GTAGGGTGTG 420
CGAGTGTGTG TGTTTGTGTG TAAAAATGTG TGTGTGAGTG TGTGAGAGAG AGAAGCTATG 480
TCAATTTGAG TTTGTGTCTG TGACTGGTGT GAGAATGTGA GTAAATATGT GTTTGATTAT 540
GAGTGGGTGT GTTAGAATGT GTGTAAATGT GTGTGAATAA GAGTGTATGT GTGTGTGAAT 600
GTGTGTGTGA TGATGAGTGT GTTTGTTGAT GGAGGAAAAT CAGGGCTTTA ATGATGCTTT 660
TGAAGCTTTG TTTCACCATC AAACACGTTT GATTAGAATA TGAAATTAAA GACTTCTAGA 720
CGATATTTTT ATGCAGTTAT TTAATGAAAA AAAATTAAAC AAATGTTTGT CCTTTCTATT 780
TAGTCATTTA TTTACTTTGT ATCGTCTCCT TGATATATGA AGTTAATAAT AATAATAATA 840
ATGAAGTTAA TAATACTGTA ATATTTCTGA ACCGTATTAT AGAAAAGTTC TTTAATTATT 900
CTACTGTTGC TATGGTAACA CAACACCTAT AG 932