EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08610 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr22:118197-120346 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr22:118809-118819TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr22:118809-118819TTTAATTAGA-6.02
FOXH1MA0479.1chr22:120086-120097CCCAATCCACA+6.14
RFX1MA0509.2chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA+6.83
RFX1MA0509.2chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA-6.83
RFX2MA0600.2chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA+7.04
RFX2MA0600.2chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA-7.09
RFX3MA0798.1chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA-6.99
RFX3MA0798.1chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA+7
RFX4MA0799.1chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA+6.32
RFX4MA0799.1chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA-6.75
RFX5MA0510.2chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA-7.37
RFX5MA0510.2chr22:118863-118879TGTTACCATAGCAACA+7.3
SP8MA0747.1chr22:118818-118830AGTGGGCGTGTC-6.37
ZIC1MA0696.1chr22:120037-120051CTCAGCAGGGGGGC-6.18
ZIC3MA0697.1chr22:120036-120051GCTCAGCAGGGGGGC-6.31
ZIC4MA0751.1chr22:120036-120051GCTCAGCAGGGGGGC-6.24
ZNF143MA0088.2chr22:119651-119667CAGTGCATTATGGGAG-7.99
Enhancer Sequence
TTTTCAGCTC AGTTCCTTAT TTACCACAAT AGACCGGTAC ATCCACCACA TTACTGCTGC 60
CGCTGCACTG ATCCACCTGT CAATCTCACG CTCCATCCTT CCCTCACTCG TGTACAAAAC 120
CCCAAGATAC TTGATCTCCT CTACCAGGTC GCTTCGAGAA AAAGCACGTC TATGGCACGA 180
TTCATGGGTT TATNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNACACACA 300
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACAGAGGAA GCAATGCTGG 360
GAACCCATCG ACAACACACA CACACTCAAA CACATGCACA CACACTAAAA CACATACACA 420
AACTTACACA TAAGCATGCA CACACATACT TACACACACA CAAACACACA CACTGTCATG 480
CGCACAAAAA CACACTCATA CACATGCACA AACACACACA TGCATGCACA CACACACACA 540
CACACACACA CACTCACACA CACTCACACA CACTCCTGCT GCTGCTCTGG TAACTGATGA 600
ATATGCAGGT GATTTAATTA GAGTGGGCGT GTCTGATCAG CACATGATGA AGTGAGAGCT 660
GGAGTGTGTT ACCATAGCAA CACGATGAGT GTGATGAGAG TGTTCAGATA CTTAATGACA 720
ATTATAGATG ATGATAAAGT AAAGATGAGT CTCTGTCTGT CTGTCTGTCT ATCTATCTAT 780
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 840
CTATCTATCT ATCTATCTGT CTTATTTGTC TGTCATCAGC AACAACCTAG CAACCACTAG 900
CAATGTCGAG CACCTTAGTA ACCAGCCTGT CTGAGTGTTC TATTTATATT TTGTCAGTCC 960
TGCAGAAAGT GTTTCTGTGC ACAGCAGAAG AGAGTAAAGC AGAAGAGTCT CACACACACA 1020
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA AAAACACAAA 1080
CACACACAAA CACACACACA CACACACTCA CACACACACA CATACAAACA CACACACGGC 1140
ATGTGTGTAT GAGTCAGACA AGTATAAGTA TGTTGTGTGT GTGTTTGTGT AGTGTGCAAG 1200
TATGTGTGTG TGTGTGGGTT TGCACGAGTA TGTGTGTATA TATAAGTTTG TTTAAAGTGA 1260
GTGTGTGCGT GTGTAGTGTA TTGATGTTTG TGTGTATATA ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1320
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGCGC GCACATACAA 1380
GCGTGTGTGA GTCTCAAATC CTGCAATCAG TGGTGTGATT GGCTCTCGAC GTCTTGATTA 1440
CAGTGCTGGT GCTGCAGTGC ATTATGGGAG CGTCTGTGCT GTGTGTGCGT GTGTGTGTGT 1500
GTGTGTGTGT GTGTGTGAAG GTCAGTGTTT CTCCTGCGCT TTCGGGACTT TATGAAATGA 1560
GGAGTGTGAG AGTGAAGGAC AGATTCATGA TGATCTGACC TCTGATTGGT GGCTTCACCT 1620
GTCAGTCAAA TGCTCAGTGG GCGGGTCCTC TGCTCAGTCT GGGCTTCATT TACAAACCTG 1680
TCAGCATTTG TGCATTTGTG TGTGTGAGTT GTGTTTGCAT GTGTGTGTGT TTGTATGTGT 1740
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTCAAG GGAACTAACG 1800
AGTGTGTCCT CCACCTGAGC TCAAAGCGGA GCAGAGCGCG CTCAGCAGGG GGGCGGAGCT 1860
AATCCTGCAT CATCAGCCAA TCACACGGCC CCAATCCACA TGACCCGCTC CAGCAGCAGG 1920
ACACATGTGG ACACAACGAC TCTACTCATC AATATCAGTG ACAGAGAGAA TAACACACAC 1980
ACACACACAC AAACACACAC ACACACACTG TATCCAAGAC ACACACTCAC ACCTCCTACG 2040
CAACACATTT CCCTGCTGTT ACATACAGAT TCAGCATGTT GATGATCCAG CATTGTGTGT 2100
GTGTGTGTGT GTGCAGTTCT AACCCAGCAC CTTCAGTCTG ACTGTCTCA 2149