EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08357 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr21:23184179-23185593 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr21:23184439-23184451AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr21:23184913-23184925AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr21:23184917-23184929AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr21:23184921-23184933AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr21:23184925-23184937AAACAAACAAAC-6.32
HOXA13MA0650.2chr21:23184881-23184892ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr21:23184881-23184892ACCAATAAAAC+6.32
NKX2-3MA0672.1chr21:23185125-23185135ACCACTTGAA+6.02
NKX2-3MA0672.1chr21:23184311-23184321TTCAAGTGGT-6.02
SOX10MA0442.2chr21:23184453-23184464AAAACAAAGCA+6.02
SOX15MA1152.1chr21:23184463-23184473AAAACAATAG-6.02
ZNF384MA1125.1chr21:23184505-23184517AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr21:23184506-23184518AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr21:23184507-23184519AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr21:23184508-23184520AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
GAGGCCGGTT CTGCTCTTTC CTTATTTGCC TTTCATGAGC AGGGAGGGTG AATCCAGGTC 60
TTGAAATATA ATTGGATGGG TAGACATCAA TTTAAAAGTG GTTTTGTAGA AAGCTAGTAG 120
CCTGATATAG ATTTCAAGTG GTCCAGATGA GATGTAAGTT CAAAGAAAAC AAAACTAACA 180
AAAATACAAA ACAAACTACA TATTTTATAT TGTTGGACCA GTTGAACTGA TTGGCCAAAG 240
CAAAAGCAGA ATAAAATCAA AAACAAACAA ACAAAAAACA AAGCAAAACA ATAGTTTATA 300
CTATGGGCCT AGTTAAGCTA ATGGACAAAA AAAAAAAAAA ACACCAAACG AAGACAAAAA 360
CAACAAACAA CTAAACTGAG ATTAAAAAAT ATAAATACCA AAATAAAAAC AAACAAAAAC 420
AAAACTGAGA GAAATAAGAC CACAAAAACC ACAATATAAA TATAAAACAA ATCGCAACAA 480
AACAAAAACC AAACAGACAA AAAAAAAACT GACACAAAAA CAAAAAAATA AATAAATAAC 540
AAAATAAAAA CAAACAAAAA AACAAACAAA AATTGACCAA TATAAACACA AAAAACACAA 600
TATAAACAAA TCAAACAAAC ATAAAACAAA AAAATTACAA CAAAACAAAA TCACAACAAA 660
AAACAACAAC AACTAAACAG ACACAACAAA AACAAAATTG AGACCAATAA AACACAAAAA 720
CCACAATATA AACAAAACAA ACAAACAAAC AAACAAACAT CACACAAATC ACAACAAGAA 780
TTAAACACAA AACAAAAACA AAACAAAAAA AAATTATCAC AAAACAAAAC GTACACCTCA 840
CGCTCAAAAA AAATTAAAAC AGAGCACAAT AAAAAGAACC AAAGTCACTT GATAGCCAAT 900
AAGTAGCTAA ATGGGTTTCA AGTCAGATAT GAAAGTGGAT ATGAAAACCA CTTGAAGAGG 960
TGAAAAAAAA ATTCCCAGGC CTACACATTT TAAATCACGC TTCTGAGTAC TTAAAGCAAT 1020
CTTGAGCCTC GACAGCGATG TGATAAATGT TAACCACTAA CTGACAAATG CTGCTAAAAC 1080
AGTCAAAAGA ACAGTACAGA AGTGCTAGAC AGGCTGCACA TAGTTAACAG AGCCCATGTA 1140
TGCTCCACAG GTCAATAACC TGTAAAGATT TAACATTTAG TGCCCATTAT TTCCTGCTTT 1200
CAAGTCACAC ATTGTCAAAA GCACTCTCTA GTTTATTAAG GCCCAGACCA GGAGAGTGGG 1260
GGACGGGTGA CGGGCTACAC AGCACGACGT ATGGGACAGA CACACAGTAC AGGTCATTAT 1320
TAAACCGCTC CACACTTAAC ACAGGCATGT GATAGAGGGG TGTTAAGTCT TCCAAAAAAA 1380
AGTCTGGTTT TCCTAAAATC AAAAACAGCC TGAA 1414